Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y698

CACNG2, Voltage-dependent calcium channel gamma-2 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG2Q9Y698 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNG2Q9Y698 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNG2Q9Y698 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNG2Q9Y698 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNG2Q9Y698 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNG2Q9Y698 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CACNG2Q9Y698 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CACNG2Q9Y698 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CACNG2Q9Y698 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CACNG2Q9Y698 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CACNG2Q9Y698 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CACNG2Q9Y698 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CACNG2Q9Y698 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CACNG2Q9Y698 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CACNG2Q9Y698 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CACNG2Q9Y698 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CACNG2Q9Y698 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CACNG2Q9Y698 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CACNG2Q9Y698 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CACNG2Q9Y698 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CACNG2Q9Y698 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CACNG2Q9Y698 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNG2Q9Y698 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNG2Q9Y698 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNG2Q9Y698 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNG2Q9Y698 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNG2Q9Y698 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNG2Q9Y698 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNG2Q9Y698 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNG2Q9Y698 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNG2Q9Y698 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNG2Q9Y698 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNG2Q9Y698 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNG2Q9Y698 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNG2Q9Y698 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNG2Q9Y698 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNG2Q9Y698 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNG2Q9Y698 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNG2Q9Y698 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNG2Q9Y698 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNG2Q9Y698 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNG2Q9Y698 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNG2Q9Y698 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CACNG2Q9Y698 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CACNG2Q9Y698 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CACNG2Q9Y698 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CACNG2Q9Y698 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CACNG2Q9Y698 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CACNG2Q9Y698 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CACNG2Q9Y698 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CACNG2Q9Y698 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CACNG2Q9Y698 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CACNG2Q9Y698 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CACNG2Q9Y698 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CACNG2Q9Y698 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CACNG2Q9Y698 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
CACNG2Q9Y698 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CACNG2Q9Y698 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CACNG2Q9Y698 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CACNG2Q9Y698 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CACNG2Q9Y698 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CACNG2Q9Y698 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CACNG2Q9Y698 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNG2Q9Y698 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNG2Q9Y698 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNG2Q9Y698 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNG2Q9Y698 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNG2Q9Y698 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CACNG2Q9Y698 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CACNG2Q9Y698 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CACNG2Q9Y698 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CACNG2Q9Y698 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CACNG2Q9Y698 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNG2Q9Y698 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNG2Q9Y698 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNG2Q9Y698 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNG2Q9Y698 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNG2Q9Y698 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNG2Q9Y698 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNG2Q9Y698 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNG2Q9Y698 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNG2Q9Y698 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNG2Q9Y698 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CACNG2Q9Y698 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNG2Q9Y698 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNG2Q9Y698 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CACNG2Q9Y698 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CACNG2Q9Y698 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CACNG2Q9Y698 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CACNG2Q9Y698 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CACNG2Q9Y698 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CACNG2Q9Y698 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CACNG2Q9Y698 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNG2Q9Y698 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNG2Q9Y698 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNG2Q9Y698 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNG2Q9Y698 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNG2Q9Y698 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CACNG2Q9Y698 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACNG2Q9Y698 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms