Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W9

SNX11, Sorting nexin-11, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX11Q9Y5W9 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNX11Q9Y5W9 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNX11Q9Y5W9 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SNX11Q9Y5W9 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SNX11Q9Y5W9 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SNX11Q9Y5W9 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SNX11Q9Y5W9 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SNX11Q9Y5W9 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SNX11Q9Y5W9 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SNX11Q9Y5W9 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SNX11Q9Y5W9 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SNX11Q9Y5W9 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SNX11Q9Y5W9 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SNX11Q9Y5W9 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SNX11Q9Y5W9 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SNX11Q9Y5W9 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SNX11Q9Y5W9 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNX11Q9Y5W9 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SNX11Q9Y5W9 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SNX11Q9Y5W9 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SNX11Q9Y5W9 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SNX11Q9Y5W9 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SNX11Q9Y5W9 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SNX11Q9Y5W9 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SNX11Q9Y5W9 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SNX11Q9Y5W9 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SNX11Q9Y5W9 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNX11Q9Y5W9 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SNX11Q9Y5W9 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNX11Q9Y5W9 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNX11Q9Y5W9 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SNX11Q9Y5W9 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SNX11Q9Y5W9 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SNX11Q9Y5W9 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNX11Q9Y5W9 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNX11Q9Y5W9 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNX11Q9Y5W9 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNX11Q9Y5W9 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNX11Q9Y5W9 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNX11Q9Y5W9 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNX11Q9Y5W9 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SNX11Q9Y5W9 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SNX11Q9Y5W9 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SNX11Q9Y5W9 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SNX11Q9Y5W9 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SNX11Q9Y5W9 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SNX11Q9Y5W9 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SNX11Q9Y5W9 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNX11Q9Y5W9 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNX11Q9Y5W9 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNX11Q9Y5W9 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SNX11Q9Y5W9 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SNX11Q9Y5W9 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SNX11Q9Y5W9 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SNX11Q9Y5W9 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SNX11Q9Y5W9 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNX11Q9Y5W9 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNX11Q9Y5W9 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNX11Q9Y5W9 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNX11Q9Y5W9 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNX11Q9Y5W9 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNX11Q9Y5W9 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SNX11Q9Y5W9 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SNX11Q9Y5W9 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SNX11Q9Y5W9 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SNX11Q9Y5W9 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SNX11Q9Y5W9 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SNX11Q9Y5W9 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SNX11Q9Y5W9 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SNX11Q9Y5W9 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SNX11Q9Y5W9 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SNX11Q9Y5W9 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SNX11Q9Y5W9 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SNX11Q9Y5W9 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNX11Q9Y5W9 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNX11Q9Y5W9 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNX11Q9Y5W9 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNX11Q9Y5W9 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SNX11Q9Y5W9 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SNX11Q9Y5W9 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNX11Q9Y5W9 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNX11Q9Y5W9 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNX11Q9Y5W9 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNX11Q9Y5W9 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNX11Q9Y5W9 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNX11Q9Y5W9 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SNX11Q9Y5W9 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNX11Q9Y5W9 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNX11Q9Y5W9 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNX11Q9Y5W9 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNX11Q9Y5W9 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNX11Q9Y5W9 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SNX11Q9Y5W9 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNX11Q9Y5W9 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNX11Q9Y5W9 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SNX11Q9Y5W9 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SNX11Q9Y5W9 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SNX11Q9Y5W9 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SNX11Q9Y5W9 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SNX11Q9Y5W9 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms