Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5K3

PCYT1B, Choline-phosphate cytidylyltransferase B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCYT1BQ9Y5K3 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PCYT1BQ9Y5K3 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PCYT1BQ9Y5K3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PCYT1BQ9Y5K3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PCYT1BQ9Y5K3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PCYT1BQ9Y5K3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PCYT1BQ9Y5K3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PCYT1BQ9Y5K3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PCYT1BQ9Y5K3 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PCYT1BQ9Y5K3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PCYT1BQ9Y5K3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PCYT1BQ9Y5K3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PCYT1BQ9Y5K3 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PCYT1BQ9Y5K3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PCYT1BQ9Y5K3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PCYT1BQ9Y5K3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PCYT1BQ9Y5K3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PCYT1BQ9Y5K3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PCYT1BQ9Y5K3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PCYT1BQ9Y5K3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PCYT1BQ9Y5K3 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PCYT1BQ9Y5K3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PCYT1BQ9Y5K3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PCYT1BQ9Y5K3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PCYT1BQ9Y5K3 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
PCYT1BQ9Y5K3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PCYT1BQ9Y5K3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PCYT1BQ9Y5K3 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PCYT1BQ9Y5K3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PCYT1BQ9Y5K3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PCYT1BQ9Y5K3 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PCYT1BQ9Y5K3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PCYT1BQ9Y5K3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PCYT1BQ9Y5K3 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCYT1BQ9Y5K3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCYT1BQ9Y5K3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCYT1BQ9Y5K3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCYT1BQ9Y5K3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCYT1BQ9Y5K3 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCYT1BQ9Y5K3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PCYT1BQ9Y5K3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PCYT1BQ9Y5K3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PCYT1BQ9Y5K3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PCYT1BQ9Y5K3 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PCYT1BQ9Y5K3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PCYT1BQ9Y5K3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PCYT1BQ9Y5K3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PCYT1BQ9Y5K3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PCYT1BQ9Y5K3 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PCYT1BQ9Y5K3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PCYT1BQ9Y5K3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PCYT1BQ9Y5K3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PCYT1BQ9Y5K3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PCYT1BQ9Y5K3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PCYT1BQ9Y5K3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PCYT1BQ9Y5K3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCYT1BQ9Y5K3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PCYT1BQ9Y5K3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PCYT1BQ9Y5K3 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PCYT1BQ9Y5K3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PCYT1BQ9Y5K3 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PCYT1BQ9Y5K3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCYT1BQ9Y5K3 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCYT1BQ9Y5K3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCYT1BQ9Y5K3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCYT1BQ9Y5K3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCYT1BQ9Y5K3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PCYT1BQ9Y5K3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCYT1BQ9Y5K3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCYT1BQ9Y5K3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCYT1BQ9Y5K3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCYT1BQ9Y5K3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCYT1BQ9Y5K3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCYT1BQ9Y5K3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCYT1BQ9Y5K3 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCYT1BQ9Y5K3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCYT1BQ9Y5K3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PCYT1BQ9Y5K3 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PCYT1BQ9Y5K3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PCYT1BQ9Y5K3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PCYT1BQ9Y5K3 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCYT1BQ9Y5K3 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCYT1BQ9Y5K3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCYT1BQ9Y5K3 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCYT1BQ9Y5K3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCYT1BQ9Y5K3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCYT1BQ9Y5K3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCYT1BQ9Y5K3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCYT1BQ9Y5K3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCYT1BQ9Y5K3 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCYT1BQ9Y5K3 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCYT1BQ9Y5K3 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCYT1BQ9Y5K3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCYT1BQ9Y5K3 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCYT1BQ9Y5K3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCYT1BQ9Y5K3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCYT1BQ9Y5K3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCYT1BQ9Y5K3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PCYT1BQ9Y5K3 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PCYT1BQ9Y5K3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms