Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y512

SAMM50, Sorting and assembly machinery component 50 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMM50Q9Y512 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SAMM50Q9Y512 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SAMM50Q9Y512 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SAMM50Q9Y512 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SAMM50Q9Y512 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SAMM50Q9Y512 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SAMM50Q9Y512 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
SAMM50Q9Y512 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SAMM50Q9Y512 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SAMM50Q9Y512 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SAMM50Q9Y512 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SAMM50Q9Y512 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SAMM50Q9Y512 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SAMM50Q9Y512 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SAMM50Q9Y512 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SAMM50Q9Y512 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SAMM50Q9Y512 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SAMM50Q9Y512 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SAMM50Q9Y512 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
SAMM50Q9Y512 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SAMM50Q9Y512 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SAMM50Q9Y512 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SAMM50Q9Y512 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SAMM50Q9Y512 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SAMM50Q9Y512 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SAMM50Q9Y512 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SAMM50Q9Y512 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SAMM50Q9Y512 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SAMM50Q9Y512 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
SAMM50Q9Y512 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SAMM50Q9Y512 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SAMM50Q9Y512 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SAMM50Q9Y512 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SAMM50Q9Y512 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
SAMM50Q9Y512 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SAMM50Q9Y512 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SAMM50Q9Y512 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SAMM50Q9Y512 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SAMM50Q9Y512 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SAMM50Q9Y512 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SAMM50Q9Y512 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SAMM50Q9Y512 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SAMM50Q9Y512 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SAMM50Q9Y512 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SAMM50Q9Y512 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SAMM50Q9Y512 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SAMM50Q9Y512 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SAMM50Q9Y512 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SAMM50Q9Y512 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SAMM50Q9Y512 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SAMM50Q9Y512 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SAMM50Q9Y512 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SAMM50Q9Y512 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SAMM50Q9Y512 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SAMM50Q9Y512 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SAMM50Q9Y512 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SAMM50Q9Y512 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SAMM50Q9Y512 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SAMM50Q9Y512 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SAMM50Q9Y512 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SAMM50Q9Y512 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SAMM50Q9Y512 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SAMM50Q9Y512 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SAMM50Q9Y512 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SAMM50Q9Y512 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SAMM50Q9Y512 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SAMM50Q9Y512 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SAMM50Q9Y512 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SAMM50Q9Y512 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SAMM50Q9Y512 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SAMM50Q9Y512 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SAMM50Q9Y512 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SAMM50Q9Y512 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SAMM50Q9Y512 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SAMM50Q9Y512 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.16
SAMM50Q9Y512 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
SAMM50Q9Y512 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SAMM50Q9Y512 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SAMM50Q9Y512 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SAMM50Q9Y512 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SAMM50Q9Y512 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SAMM50Q9Y512 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SAMM50Q9Y512 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SAMM50Q9Y512 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SAMM50Q9Y512 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SAMM50Q9Y512 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SAMM50Q9Y512 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SAMM50Q9Y512 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SAMM50Q9Y512 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SAMM50Q9Y512 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SAMM50Q9Y512 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SAMM50Q9Y512 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SAMM50Q9Y512 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SAMM50Q9Y512 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SAMM50Q9Y512 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SAMM50Q9Y512 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
SAMM50Q9Y512 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SAMM50Q9Y512 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SAMM50Q9Y512 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SAMM50Q9Y512 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms