Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4X4

KLF12, Krueppel-like factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF12Q9Y4X4 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLF12Q9Y4X4 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLF12Q9Y4X4 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLF12Q9Y4X4 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLF12Q9Y4X4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLF12Q9Y4X4 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLF12Q9Y4X4 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLF12Q9Y4X4 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLF12Q9Y4X4 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLF12Q9Y4X4 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLF12Q9Y4X4 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLF12Q9Y4X4 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLF12Q9Y4X4 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLF12Q9Y4X4 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLF12Q9Y4X4 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLF12Q9Y4X4 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
KLF12Q9Y4X4 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
KLF12Q9Y4X4 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLF12Q9Y4X4 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLF12Q9Y4X4 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLF12Q9Y4X4 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLF12Q9Y4X4 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLF12Q9Y4X4 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLF12Q9Y4X4 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLF12Q9Y4X4 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLF12Q9Y4X4 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLF12Q9Y4X4 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLF12Q9Y4X4 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLF12Q9Y4X4 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLF12Q9Y4X4 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLF12Q9Y4X4 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLF12Q9Y4X4 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLF12Q9Y4X4 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLF12Q9Y4X4 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLF12Q9Y4X4 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLF12Q9Y4X4 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLF12Q9Y4X4 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLF12Q9Y4X4 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
KLF12Q9Y4X4 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLF12Q9Y4X4 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLF12Q9Y4X4 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLF12Q9Y4X4 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLF12Q9Y4X4 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLF12Q9Y4X4 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLF12Q9Y4X4 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLF12Q9Y4X4 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLF12Q9Y4X4 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLF12Q9Y4X4 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLF12Q9Y4X4 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLF12Q9Y4X4 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLF12Q9Y4X4 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLF12Q9Y4X4 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
KLF12Q9Y4X4 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLF12Q9Y4X4 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLF12Q9Y4X4 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLF12Q9Y4X4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
KLF12Q9Y4X4 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
KLF12Q9Y4X4 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLF12Q9Y4X4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLF12Q9Y4X4 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLF12Q9Y4X4 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLF12Q9Y4X4 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLF12Q9Y4X4 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLF12Q9Y4X4 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
KLF12Q9Y4X4 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLF12Q9Y4X4 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLF12Q9Y4X4 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLF12Q9Y4X4 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLF12Q9Y4X4 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLF12Q9Y4X4 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
KLF12Q9Y4X4 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLF12Q9Y4X4 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLF12Q9Y4X4 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLF12Q9Y4X4 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
KLF12Q9Y4X4 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLF12Q9Y4X4 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLF12Q9Y4X4 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
KLF12Q9Y4X4 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLF12Q9Y4X4 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLF12Q9Y4X4 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLF12Q9Y4X4 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLF12Q9Y4X4 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLF12Q9Y4X4 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLF12Q9Y4X4 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLF12Q9Y4X4 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLF12Q9Y4X4 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLF12Q9Y4X4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLF12Q9Y4X4 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLF12Q9Y4X4 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLF12Q9Y4X4 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLF12Q9Y4X4 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLF12Q9Y4X4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLF12Q9Y4X4 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLF12Q9Y4X4 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLF12Q9Y4X4 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLF12Q9Y4X4 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLF12Q9Y4X4 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLF12Q9Y4X4 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
KLF12Q9Y4X4 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
KLF12Q9Y4X4 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms