Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SH3BP1Q9Y3L3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SH3BP1Q9Y3L3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SH3BP1Q9Y3L3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SH3BP1Q9Y3L3 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SH3BP1Q9Y3L3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SH3BP1Q9Y3L3 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SH3BP1Q9Y3L3 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SH3BP1Q9Y3L3 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
SH3BP1Q9Y3L3 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SH3BP1Q9Y3L3 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SH3BP1Q9Y3L3 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SH3BP1Q9Y3L3 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SH3BP1Q9Y3L3 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SH3BP1Q9Y3L3 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SH3BP1Q9Y3L3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SH3BP1Q9Y3L3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SH3BP1Q9Y3L3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SH3BP1Q9Y3L3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SH3BP1Q9Y3L3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SH3BP1Q9Y3L3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SH3BP1Q9Y3L3 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SH3BP1Q9Y3L3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SH3BP1Q9Y3L3 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SH3BP1Q9Y3L3 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SH3BP1Q9Y3L3 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SH3BP1Q9Y3L3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SH3BP1Q9Y3L3 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SH3BP1Q9Y3L3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SH3BP1Q9Y3L3 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SH3BP1Q9Y3L3 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SH3BP1Q9Y3L3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SH3BP1Q9Y3L3 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SH3BP1Q9Y3L3 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
SH3BP1Q9Y3L3 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SH3BP1Q9Y3L3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SH3BP1Q9Y3L3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SH3BP1Q9Y3L3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SH3BP1Q9Y3L3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SH3BP1Q9Y3L3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SH3BP1Q9Y3L3 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SH3BP1Q9Y3L3 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SH3BP1Q9Y3L3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SH3BP1Q9Y3L3 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SH3BP1Q9Y3L3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SH3BP1Q9Y3L3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SH3BP1Q9Y3L3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SH3BP1Q9Y3L3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SH3BP1Q9Y3L3 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SH3BP1Q9Y3L3 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SH3BP1Q9Y3L3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SH3BP1Q9Y3L3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SH3BP1Q9Y3L3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
SH3BP1Q9Y3L3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
SH3BP1Q9Y3L3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SH3BP1Q9Y3L3 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SH3BP1Q9Y3L3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SH3BP1Q9Y3L3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SH3BP1Q9Y3L3 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SH3BP1Q9Y3L3 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
SH3BP1Q9Y3L3 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SH3BP1Q9Y3L3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SH3BP1Q9Y3L3 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
SH3BP1Q9Y3L3 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SH3BP1Q9Y3L3 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SH3BP1Q9Y3L3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SH3BP1Q9Y3L3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SH3BP1Q9Y3L3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SH3BP1Q9Y3L3 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SH3BP1Q9Y3L3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SH3BP1Q9Y3L3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SH3BP1Q9Y3L3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
SH3BP1Q9Y3L3 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SH3BP1Q9Y3L3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SH3BP1Q9Y3L3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SH3BP1Q9Y3L3 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
SH3BP1Q9Y3L3 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
SH3BP1Q9Y3L3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SH3BP1Q9Y3L3 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
SH3BP1Q9Y3L3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SH3BP1Q9Y3L3 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SH3BP1Q9Y3L3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SH3BP1Q9Y3L3 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
SH3BP1Q9Y3L3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SH3BP1Q9Y3L3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SH3BP1Q9Y3L3 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
SH3BP1Q9Y3L3 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SH3BP1Q9Y3L3 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SH3BP1Q9Y3L3 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SH3BP1Q9Y3L3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SH3BP1Q9Y3L3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SH3BP1Q9Y3L3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SH3BP1Q9Y3L3 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SH3BP1Q9Y3L3 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SH3BP1Q9Y3L3 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SH3BP1Q9Y3L3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SH3BP1Q9Y3L3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SH3BP1Q9Y3L3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms