Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A4

RRP7A, Ribosomal RNA-processing protein 7 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP7AQ9Y3A4 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC33.71■■■□□ 2.99
RRP7AQ9Y3A4 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
RRP7AQ9Y3A4 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
RRP7AQ9Y3A4 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
RRP7AQ9Y3A4 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
RRP7AQ9Y3A4 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
RRP7AQ9Y3A4 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
RRP7AQ9Y3A4 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
RRP7AQ9Y3A4 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
RRP7AQ9Y3A4 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
RRP7AQ9Y3A4 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
RRP7AQ9Y3A4 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
RRP7AQ9Y3A4 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
RRP7AQ9Y3A4 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
RRP7AQ9Y3A4 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
RRP7AQ9Y3A4 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
RRP7AQ9Y3A4 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.65■■■□□ 2.98
RRP7AQ9Y3A4 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
RRP7AQ9Y3A4 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
RRP7AQ9Y3A4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
RRP7AQ9Y3A4 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
RRP7AQ9Y3A4 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
RRP7AQ9Y3A4 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
RRP7AQ9Y3A4 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
RRP7AQ9Y3A4 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC33.63■■■□□ 2.97
RRP7AQ9Y3A4 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
RRP7AQ9Y3A4 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
RRP7AQ9Y3A4 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC33.62■■■□□ 2.97
RRP7AQ9Y3A4 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
RRP7AQ9Y3A4 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
RRP7AQ9Y3A4 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
RRP7AQ9Y3A4 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
RRP7AQ9Y3A4 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
RRP7AQ9Y3A4 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC33.6■■■□□ 2.97
RRP7AQ9Y3A4 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
RRP7AQ9Y3A4 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
RRP7AQ9Y3A4 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
RRP7AQ9Y3A4 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
RRP7AQ9Y3A4 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
RRP7AQ9Y3A4 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
RRP7AQ9Y3A4 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
RRP7AQ9Y3A4 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
RRP7AQ9Y3A4 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
RRP7AQ9Y3A4 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
RRP7AQ9Y3A4 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
RRP7AQ9Y3A4 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
RRP7AQ9Y3A4 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
RRP7AQ9Y3A4 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
RRP7AQ9Y3A4 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
RRP7AQ9Y3A4 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
RRP7AQ9Y3A4 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.96
RRP7AQ9Y3A4 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.95
RRP7AQ9Y3A4 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
RRP7AQ9Y3A4 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
RRP7AQ9Y3A4 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
RRP7AQ9Y3A4 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC33.49■■■□□ 2.95
RRP7AQ9Y3A4 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
RRP7AQ9Y3A4 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
RRP7AQ9Y3A4 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
RRP7AQ9Y3A4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
RRP7AQ9Y3A4 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
RRP7AQ9Y3A4 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
RRP7AQ9Y3A4 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
RRP7AQ9Y3A4 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
RRP7AQ9Y3A4 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
RRP7AQ9Y3A4 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
RRP7AQ9Y3A4 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
RRP7AQ9Y3A4 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
RRP7AQ9Y3A4 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
RRP7AQ9Y3A4 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
RRP7AQ9Y3A4 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
RRP7AQ9Y3A4 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
RRP7AQ9Y3A4 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
RRP7AQ9Y3A4 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
RRP7AQ9Y3A4 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
RRP7AQ9Y3A4 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
RRP7AQ9Y3A4 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
RRP7AQ9Y3A4 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
RRP7AQ9Y3A4 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
RRP7AQ9Y3A4 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
RRP7AQ9Y3A4 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
RRP7AQ9Y3A4 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
RRP7AQ9Y3A4 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
RRP7AQ9Y3A4 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
RRP7AQ9Y3A4 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
RRP7AQ9Y3A4 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
RRP7AQ9Y3A4 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
RRP7AQ9Y3A4 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
RRP7AQ9Y3A4 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
RRP7AQ9Y3A4 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
RRP7AQ9Y3A4 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
RRP7AQ9Y3A4 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
RRP7AQ9Y3A4 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
RRP7AQ9Y3A4 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
RRP7AQ9Y3A4 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC33.36■■■□□ 2.93
RRP7AQ9Y3A4 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
RRP7AQ9Y3A4 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
RRP7AQ9Y3A4 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
RRP7AQ9Y3A4 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
RRP7AQ9Y3A4 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms