Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K7

KDM2A, Lysine-specific demethylase 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM2AQ9Y2K7 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.67■■■■□ 3.46
KDM2AQ9Y2K7 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
KDM2AQ9Y2K7 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
KDM2AQ9Y2K7 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
KDM2AQ9Y2K7 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
KDM2AQ9Y2K7 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
KDM2AQ9Y2K7 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC36.66■■■■□ 3.46
KDM2AQ9Y2K7 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC36.66■■■■□ 3.46
KDM2AQ9Y2K7 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC36.66■■■■□ 3.46
KDM2AQ9Y2K7 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC36.65■■■■□ 3.46
KDM2AQ9Y2K7 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
KDM2AQ9Y2K7 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
KDM2AQ9Y2K7 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC36.64■■■■□ 3.46
KDM2AQ9Y2K7 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
KDM2AQ9Y2K7 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC36.64■■■■□ 3.46
KDM2AQ9Y2K7 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
KDM2AQ9Y2K7 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC36.64■■■■□ 3.46
KDM2AQ9Y2K7 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.63■■■■□ 3.45
KDM2AQ9Y2K7 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.61■■■■□ 3.45
KDM2AQ9Y2K7 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC36.61■■■■□ 3.45
KDM2AQ9Y2K7 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC36.61■■■■□ 3.45
KDM2AQ9Y2K7 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC36.61■■■■□ 3.45
KDM2AQ9Y2K7 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
KDM2AQ9Y2K7 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
KDM2AQ9Y2K7 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
KDM2AQ9Y2K7 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC36.6■■■■□ 3.45
KDM2AQ9Y2K7 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.6■■■■□ 3.45
KDM2AQ9Y2K7 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
KDM2AQ9Y2K7 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
KDM2AQ9Y2K7 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
KDM2AQ9Y2K7 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC36.58■■■■□ 3.45
KDM2AQ9Y2K7 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
KDM2AQ9Y2K7 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC36.58■■■■□ 3.45
KDM2AQ9Y2K7 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
KDM2AQ9Y2K7 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.44
KDM2AQ9Y2K7 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC36.56■■■■□ 3.44
KDM2AQ9Y2K7 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
KDM2AQ9Y2K7 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC36.56■■■■□ 3.44
KDM2AQ9Y2K7 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC36.56■■■■□ 3.44
KDM2AQ9Y2K7 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
KDM2AQ9Y2K7 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
KDM2AQ9Y2K7 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC36.54■■■■□ 3.44
KDM2AQ9Y2K7 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
KDM2AQ9Y2K7 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
KDM2AQ9Y2K7 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC36.53■■■■□ 3.44
KDM2AQ9Y2K7 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
KDM2AQ9Y2K7 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC36.51■■■■□ 3.44
KDM2AQ9Y2K7 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
KDM2AQ9Y2K7 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC36.5■■■■□ 3.43
KDM2AQ9Y2K7 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
KDM2AQ9Y2K7 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC36.5■■■■□ 3.43
KDM2AQ9Y2K7 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
KDM2AQ9Y2K7 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
KDM2AQ9Y2K7 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
KDM2AQ9Y2K7 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
KDM2AQ9Y2K7 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
KDM2AQ9Y2K7 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
KDM2AQ9Y2K7 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC36.49■■■■□ 3.43
KDM2AQ9Y2K7 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
KDM2AQ9Y2K7 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.48■■■■□ 3.43
KDM2AQ9Y2K7 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC36.48■■■■□ 3.43
KDM2AQ9Y2K7 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC36.48■■■■□ 3.43
KDM2AQ9Y2K7 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
KDM2AQ9Y2K7 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
KDM2AQ9Y2K7 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC36.47■■■■□ 3.43
KDM2AQ9Y2K7 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
KDM2AQ9Y2K7 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
KDM2AQ9Y2K7 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
KDM2AQ9Y2K7 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC36.46■■■■□ 3.43
KDM2AQ9Y2K7 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
KDM2AQ9Y2K7 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC36.46■■■■□ 3.43
KDM2AQ9Y2K7 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
KDM2AQ9Y2K7 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC36.45■■■■□ 3.43
KDM2AQ9Y2K7 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
KDM2AQ9Y2K7 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC36.44■■■■□ 3.42
KDM2AQ9Y2K7 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
KDM2AQ9Y2K7 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
KDM2AQ9Y2K7 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC36.43■■■■□ 3.42
KDM2AQ9Y2K7 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
KDM2AQ9Y2K7 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
KDM2AQ9Y2K7 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
KDM2AQ9Y2K7 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC36.4■■■■□ 3.42
KDM2AQ9Y2K7 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC36.4■■■■□ 3.42
KDM2AQ9Y2K7 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
KDM2AQ9Y2K7 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
KDM2AQ9Y2K7 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
KDM2AQ9Y2K7 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
KDM2AQ9Y2K7 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
KDM2AQ9Y2K7 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
KDM2AQ9Y2K7 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC36.38■■■■□ 3.41
KDM2AQ9Y2K7 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
KDM2AQ9Y2K7 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
KDM2AQ9Y2K7 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
KDM2AQ9Y2K7 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
KDM2AQ9Y2K7 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
KDM2AQ9Y2K7 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
KDM2AQ9Y2K7 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC36.34■■■■□ 3.41
KDM2AQ9Y2K7 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
KDM2AQ9Y2K7 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC36.34■■■■□ 3.41
KDM2AQ9Y2K7 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC36.34■■■■□ 3.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms