Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y296

TRAPPC4, Trafficking protein particle complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC4Q9Y296 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAPPC4Q9Y296 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAPPC4Q9Y296 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAPPC4Q9Y296 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TRAPPC4Q9Y296 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TRAPPC4Q9Y296 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TRAPPC4Q9Y296 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRAPPC4Q9Y296 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRAPPC4Q9Y296 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRAPPC4Q9Y296 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRAPPC4Q9Y296 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRAPPC4Q9Y296 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TRAPPC4Q9Y296 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRAPPC4Q9Y296 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TRAPPC4Q9Y296 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRAPPC4Q9Y296 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAPPC4Q9Y296 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAPPC4Q9Y296 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAPPC4Q9Y296 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAPPC4Q9Y296 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAPPC4Q9Y296 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAPPC4Q9Y296 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAPPC4Q9Y296 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAPPC4Q9Y296 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAPPC4Q9Y296 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAPPC4Q9Y296 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAPPC4Q9Y296 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAPPC4Q9Y296 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAPPC4Q9Y296 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAPPC4Q9Y296 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAPPC4Q9Y296 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAPPC4Q9Y296 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAPPC4Q9Y296 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAPPC4Q9Y296 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAPPC4Q9Y296 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAPPC4Q9Y296 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAPPC4Q9Y296 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAPPC4Q9Y296 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAPPC4Q9Y296 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAPPC4Q9Y296 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAPPC4Q9Y296 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAPPC4Q9Y296 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAPPC4Q9Y296 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAPPC4Q9Y296 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAPPC4Q9Y296 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAPPC4Q9Y296 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAPPC4Q9Y296 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAPPC4Q9Y296 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAPPC4Q9Y296 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAPPC4Q9Y296 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAPPC4Q9Y296 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRAPPC4Q9Y296 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRAPPC4Q9Y296 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAPPC4Q9Y296 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAPPC4Q9Y296 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAPPC4Q9Y296 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAPPC4Q9Y296 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAPPC4Q9Y296 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAPPC4Q9Y296 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAPPC4Q9Y296 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAPPC4Q9Y296 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAPPC4Q9Y296 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAPPC4Q9Y296 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAPPC4Q9Y296 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAPPC4Q9Y296 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAPPC4Q9Y296 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAPPC4Q9Y296 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAPPC4Q9Y296 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAPPC4Q9Y296 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAPPC4Q9Y296 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAPPC4Q9Y296 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAPPC4Q9Y296 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAPPC4Q9Y296 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAPPC4Q9Y296 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAPPC4Q9Y296 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAPPC4Q9Y296 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAPPC4Q9Y296 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAPPC4Q9Y296 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAPPC4Q9Y296 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAPPC4Q9Y296 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRAPPC4Q9Y296 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRAPPC4Q9Y296 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRAPPC4Q9Y296 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRAPPC4Q9Y296 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAPPC4Q9Y296 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAPPC4Q9Y296 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TRAPPC4Q9Y296 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TRAPPC4Q9Y296 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRAPPC4Q9Y296 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TRAPPC4Q9Y296 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
TRAPPC4Q9Y296 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TRAPPC4Q9Y296 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRAPPC4Q9Y296 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
TRAPPC4Q9Y296 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAPPC4Q9Y296 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAPPC4Q9Y296 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAPPC4Q9Y296 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAPPC4Q9Y296 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAPPC4Q9Y296 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAPPC4Q9Y296 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10 ms