Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y294

ASF1A, Histone chaperone ASF1A, humanhuman

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASF1AQ9Y294 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ASF1AQ9Y294 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
ASF1AQ9Y294 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
ASF1AQ9Y294 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
ASF1AQ9Y294 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ASF1AQ9Y294 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ASF1AQ9Y294 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ASF1AQ9Y294 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ASF1AQ9Y294 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
ASF1AQ9Y294 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ASF1AQ9Y294 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ASF1AQ9Y294 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ASF1AQ9Y294 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ASF1AQ9Y294 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ASF1AQ9Y294 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ASF1AQ9Y294 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ASF1AQ9Y294 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ASF1AQ9Y294 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ASF1AQ9Y294 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ASF1AQ9Y294 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ASF1AQ9Y294 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ASF1AQ9Y294 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ASF1AQ9Y294 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ASF1AQ9Y294 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
ASF1AQ9Y294 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ASF1AQ9Y294 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ASF1AQ9Y294 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ASF1AQ9Y294 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ASF1AQ9Y294 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ASF1AQ9Y294 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ASF1AQ9Y294 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ASF1AQ9Y294 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ASF1AQ9Y294 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ASF1AQ9Y294 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ASF1AQ9Y294 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ASF1AQ9Y294 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ASF1AQ9Y294 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ASF1AQ9Y294 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ASF1AQ9Y294 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ASF1AQ9Y294 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ASF1AQ9Y294 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ASF1AQ9Y294 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ASF1AQ9Y294 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ASF1AQ9Y294 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ASF1AQ9Y294 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ASF1AQ9Y294 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ASF1AQ9Y294 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ASF1AQ9Y294 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ASF1AQ9Y294 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
ASF1AQ9Y294 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ASF1AQ9Y294 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ASF1AQ9Y294 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ASF1AQ9Y294 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ASF1AQ9Y294 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ASF1AQ9Y294 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ASF1AQ9Y294 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ASF1AQ9Y294 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ASF1AQ9Y294 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ASF1AQ9Y294 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ASF1AQ9Y294 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ASF1AQ9Y294 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ASF1AQ9Y294 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ASF1AQ9Y294 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ASF1AQ9Y294 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ASF1AQ9Y294 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ASF1AQ9Y294 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ASF1AQ9Y294 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ASF1AQ9Y294 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
ASF1AQ9Y294 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ASF1AQ9Y294 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ASF1AQ9Y294 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ASF1AQ9Y294 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ASF1AQ9Y294 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ASF1AQ9Y294 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ASF1AQ9Y294 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ASF1AQ9Y294 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ASF1AQ9Y294 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ASF1AQ9Y294 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ASF1AQ9Y294 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ASF1AQ9Y294 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ASF1AQ9Y294 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ASF1AQ9Y294 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
ASF1AQ9Y294 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ASF1AQ9Y294 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ASF1AQ9Y294 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ASF1AQ9Y294 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ASF1AQ9Y294 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ASF1AQ9Y294 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ASF1AQ9Y294 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ASF1AQ9Y294 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ASF1AQ9Y294 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ASF1AQ9Y294 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ASF1AQ9Y294 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ASF1AQ9Y294 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ASF1AQ9Y294 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ASF1AQ9Y294 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ASF1AQ9Y294 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ASF1AQ9Y294 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ASF1AQ9Y294 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ASF1AQ9Y294 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.1 ms