Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y244

POMP, Proteasome maturation protein, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POMPQ9Y244 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
POMPQ9Y244 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
POMPQ9Y244 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
POMPQ9Y244 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
POMPQ9Y244 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
POMPQ9Y244 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
POMPQ9Y244 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
POMPQ9Y244 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
POMPQ9Y244 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
POMPQ9Y244 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
POMPQ9Y244 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
POMPQ9Y244 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
POMPQ9Y244 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
POMPQ9Y244 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
POMPQ9Y244 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
POMPQ9Y244 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
POMPQ9Y244 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
POMPQ9Y244 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
POMPQ9Y244 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
POMPQ9Y244 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
POMPQ9Y244 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
POMPQ9Y244 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
POMPQ9Y244 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
POMPQ9Y244 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
POMPQ9Y244 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
POMPQ9Y244 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
POMPQ9Y244 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
POMPQ9Y244 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
POMPQ9Y244 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
POMPQ9Y244 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
POMPQ9Y244 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
POMPQ9Y244 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
POMPQ9Y244 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
POMPQ9Y244 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
POMPQ9Y244 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
POMPQ9Y244 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
POMPQ9Y244 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
POMPQ9Y244 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
POMPQ9Y244 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
POMPQ9Y244 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
POMPQ9Y244 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
POMPQ9Y244 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
POMPQ9Y244 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
POMPQ9Y244 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
POMPQ9Y244 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
POMPQ9Y244 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
POMPQ9Y244 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
POMPQ9Y244 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
POMPQ9Y244 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
POMPQ9Y244 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
POMPQ9Y244 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
POMPQ9Y244 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
POMPQ9Y244 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
POMPQ9Y244 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
POMPQ9Y244 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
POMPQ9Y244 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
POMPQ9Y244 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
POMPQ9Y244 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
POMPQ9Y244 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
POMPQ9Y244 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
POMPQ9Y244 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
POMPQ9Y244 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
POMPQ9Y244 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
POMPQ9Y244 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
POMPQ9Y244 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
POMPQ9Y244 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
POMPQ9Y244 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
POMPQ9Y244 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
POMPQ9Y244 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
POMPQ9Y244 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
POMPQ9Y244 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
POMPQ9Y244 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
POMPQ9Y244 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
POMPQ9Y244 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
POMPQ9Y244 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
POMPQ9Y244 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
POMPQ9Y244 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
POMPQ9Y244 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
POMPQ9Y244 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
POMPQ9Y244 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
POMPQ9Y244 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
POMPQ9Y244 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
POMPQ9Y244 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
POMPQ9Y244 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
POMPQ9Y244 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
POMPQ9Y244 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
POMPQ9Y244 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
POMPQ9Y244 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
POMPQ9Y244 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
POMPQ9Y244 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
POMPQ9Y244 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
POMPQ9Y244 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
POMPQ9Y244 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
POMPQ9Y244 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
POMPQ9Y244 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
POMPQ9Y244 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
POMPQ9Y244 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
POMPQ9Y244 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
POMPQ9Y244 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
POMPQ9Y244 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms