Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y228

TRAF3IP3, TRAF3-interacting JNK-activating modulator, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3IP3Q9Y228 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRAF3IP3Q9Y228 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
TRAF3IP3Q9Y228 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRAF3IP3Q9Y228 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRAF3IP3Q9Y228 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRAF3IP3Q9Y228 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRAF3IP3Q9Y228 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TRAF3IP3Q9Y228 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
TRAF3IP3Q9Y228 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRAF3IP3Q9Y228 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRAF3IP3Q9Y228 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRAF3IP3Q9Y228 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRAF3IP3Q9Y228 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRAF3IP3Q9Y228 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRAF3IP3Q9Y228 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
TRAF3IP3Q9Y228 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRAF3IP3Q9Y228 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRAF3IP3Q9Y228 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRAF3IP3Q9Y228 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRAF3IP3Q9Y228 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRAF3IP3Q9Y228 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRAF3IP3Q9Y228 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRAF3IP3Q9Y228 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRAF3IP3Q9Y228 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRAF3IP3Q9Y228 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRAF3IP3Q9Y228 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRAF3IP3Q9Y228 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRAF3IP3Q9Y228 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRAF3IP3Q9Y228 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRAF3IP3Q9Y228 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRAF3IP3Q9Y228 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRAF3IP3Q9Y228 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRAF3IP3Q9Y228 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRAF3IP3Q9Y228 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRAF3IP3Q9Y228 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRAF3IP3Q9Y228 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRAF3IP3Q9Y228 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRAF3IP3Q9Y228 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRAF3IP3Q9Y228 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRAF3IP3Q9Y228 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
TRAF3IP3Q9Y228 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRAF3IP3Q9Y228 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRAF3IP3Q9Y228 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRAF3IP3Q9Y228 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRAF3IP3Q9Y228 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRAF3IP3Q9Y228 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRAF3IP3Q9Y228 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRAF3IP3Q9Y228 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
TRAF3IP3Q9Y228 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
TRAF3IP3Q9Y228 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRAF3IP3Q9Y228 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRAF3IP3Q9Y228 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRAF3IP3Q9Y228 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRAF3IP3Q9Y228 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRAF3IP3Q9Y228 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRAF3IP3Q9Y228 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRAF3IP3Q9Y228 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRAF3IP3Q9Y228 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRAF3IP3Q9Y228 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRAF3IP3Q9Y228 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRAF3IP3Q9Y228 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRAF3IP3Q9Y228 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
TRAF3IP3Q9Y228 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRAF3IP3Q9Y228 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TRAF3IP3Q9Y228 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TRAF3IP3Q9Y228 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TRAF3IP3Q9Y228 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRAF3IP3Q9Y228 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRAF3IP3Q9Y228 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRAF3IP3Q9Y228 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRAF3IP3Q9Y228 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRAF3IP3Q9Y228 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
TRAF3IP3Q9Y228 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TRAF3IP3Q9Y228 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TRAF3IP3Q9Y228 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TRAF3IP3Q9Y228 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TRAF3IP3Q9Y228 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TRAF3IP3Q9Y228 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TRAF3IP3Q9Y228 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TRAF3IP3Q9Y228 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TRAF3IP3Q9Y228 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRAF3IP3Q9Y228 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRAF3IP3Q9Y228 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRAF3IP3Q9Y228 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRAF3IP3Q9Y228 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRAF3IP3Q9Y228 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRAF3IP3Q9Y228 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRAF3IP3Q9Y228 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRAF3IP3Q9Y228 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRAF3IP3Q9Y228 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRAF3IP3Q9Y228 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRAF3IP3Q9Y228 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRAF3IP3Q9Y228 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRAF3IP3Q9Y228 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRAF3IP3Q9Y228 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRAF3IP3Q9Y228 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRAF3IP3Q9Y228 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
TRAF3IP3Q9Y228 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TRAF3IP3Q9Y228 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
TRAF3IP3Q9Y228 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms