Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ90

SPG7, Paraplegin, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPG7Q9UQ90 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
SPG7Q9UQ90 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
SPG7Q9UQ90 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC33.68■■■□□ 2.98
SPG7Q9UQ90 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
SPG7Q9UQ90 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
SPG7Q9UQ90 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
SPG7Q9UQ90 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC33.66■■■□□ 2.98
SPG7Q9UQ90 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
SPG7Q9UQ90 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
SPG7Q9UQ90 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
SPG7Q9UQ90 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
SPG7Q9UQ90 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
SPG7Q9UQ90 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
SPG7Q9UQ90 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
SPG7Q9UQ90 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
SPG7Q9UQ90 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC33.62■■■□□ 2.97
SPG7Q9UQ90 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
SPG7Q9UQ90 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
SPG7Q9UQ90 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
SPG7Q9UQ90 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC33.6■■■□□ 2.97
SPG7Q9UQ90 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
SPG7Q9UQ90 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
SPG7Q9UQ90 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
SPG7Q9UQ90 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC33.58■■■□□ 2.97
SPG7Q9UQ90 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
SPG7Q9UQ90 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC33.58■■■□□ 2.97
SPG7Q9UQ90 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
SPG7Q9UQ90 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
SPG7Q9UQ90 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
SPG7Q9UQ90 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
SPG7Q9UQ90 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
SPG7Q9UQ90 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
SPG7Q9UQ90 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
SPG7Q9UQ90 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
SPG7Q9UQ90 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
SPG7Q9UQ90 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
SPG7Q9UQ90 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
SPG7Q9UQ90 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC33.56■■■□□ 2.96
SPG7Q9UQ90 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
SPG7Q9UQ90 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
SPG7Q9UQ90 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
SPG7Q9UQ90 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
SPG7Q9UQ90 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
SPG7Q9UQ90 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
SPG7Q9UQ90 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
SPG7Q9UQ90 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
SPG7Q9UQ90 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
SPG7Q9UQ90 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
SPG7Q9UQ90 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
SPG7Q9UQ90 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
SPG7Q9UQ90 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
SPG7Q9UQ90 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
SPG7Q9UQ90 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
SPG7Q9UQ90 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
SPG7Q9UQ90 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
SPG7Q9UQ90 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
SPG7Q9UQ90 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
SPG7Q9UQ90 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
SPG7Q9UQ90 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
SPG7Q9UQ90 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
SPG7Q9UQ90 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
SPG7Q9UQ90 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC33.48■■■□□ 2.95
SPG7Q9UQ90 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
SPG7Q9UQ90 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
SPG7Q9UQ90 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
SPG7Q9UQ90 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
SPG7Q9UQ90 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
SPG7Q9UQ90 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
SPG7Q9UQ90 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
SPG7Q9UQ90 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
SPG7Q9UQ90 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
SPG7Q9UQ90 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC33.45■■■□□ 2.95
SPG7Q9UQ90 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
SPG7Q9UQ90 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
SPG7Q9UQ90 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.94
SPG7Q9UQ90 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
SPG7Q9UQ90 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
SPG7Q9UQ90 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
SPG7Q9UQ90 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
SPG7Q9UQ90 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
SPG7Q9UQ90 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
SPG7Q9UQ90 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
SPG7Q9UQ90 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
SPG7Q9UQ90 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
SPG7Q9UQ90 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.4■■■□□ 2.94
SPG7Q9UQ90 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
SPG7Q9UQ90 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
SPG7Q9UQ90 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
SPG7Q9UQ90 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
SPG7Q9UQ90 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
SPG7Q9UQ90 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
SPG7Q9UQ90 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
SPG7Q9UQ90 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
SPG7Q9UQ90 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
SPG7Q9UQ90 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
SPG7Q9UQ90 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
SPG7Q9UQ90 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
SPG7Q9UQ90 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC33.35■■■□□ 2.93
SPG7Q9UQ90 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
SPG7Q9UQ90 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
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