Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPW5

AGTPBP1, Cytosolic carboxypeptidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGTPBP1Q9UPW5 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
AGTPBP1Q9UPW5 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
AGTPBP1Q9UPW5 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
AGTPBP1Q9UPW5 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
AGTPBP1Q9UPW5 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
AGTPBP1Q9UPW5 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
AGTPBP1Q9UPW5 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
AGTPBP1Q9UPW5 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
AGTPBP1Q9UPW5 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
AGTPBP1Q9UPW5 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
AGTPBP1Q9UPW5 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
AGTPBP1Q9UPW5 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
AGTPBP1Q9UPW5 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
AGTPBP1Q9UPW5 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
AGTPBP1Q9UPW5 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
AGTPBP1Q9UPW5 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
AGTPBP1Q9UPW5 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
AGTPBP1Q9UPW5 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
AGTPBP1Q9UPW5 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
AGTPBP1Q9UPW5 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
AGTPBP1Q9UPW5 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
AGTPBP1Q9UPW5 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
AGTPBP1Q9UPW5 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
AGTPBP1Q9UPW5 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
AGTPBP1Q9UPW5 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
AGTPBP1Q9UPW5 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
AGTPBP1Q9UPW5 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
AGTPBP1Q9UPW5 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
AGTPBP1Q9UPW5 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
AGTPBP1Q9UPW5 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
AGTPBP1Q9UPW5 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
AGTPBP1Q9UPW5 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
AGTPBP1Q9UPW5 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
AGTPBP1Q9UPW5 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
AGTPBP1Q9UPW5 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
AGTPBP1Q9UPW5 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
AGTPBP1Q9UPW5 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
AGTPBP1Q9UPW5 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
AGTPBP1Q9UPW5 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
AGTPBP1Q9UPW5 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
AGTPBP1Q9UPW5 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
AGTPBP1Q9UPW5 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
AGTPBP1Q9UPW5 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
AGTPBP1Q9UPW5 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
AGTPBP1Q9UPW5 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
AGTPBP1Q9UPW5 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
AGTPBP1Q9UPW5 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
AGTPBP1Q9UPW5 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
AGTPBP1Q9UPW5 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
AGTPBP1Q9UPW5 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
AGTPBP1Q9UPW5 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
AGTPBP1Q9UPW5 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
AGTPBP1Q9UPW5 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
AGTPBP1Q9UPW5 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
AGTPBP1Q9UPW5 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
AGTPBP1Q9UPW5 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
AGTPBP1Q9UPW5 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
AGTPBP1Q9UPW5 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
AGTPBP1Q9UPW5 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
AGTPBP1Q9UPW5 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
AGTPBP1Q9UPW5 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
AGTPBP1Q9UPW5 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
AGTPBP1Q9UPW5 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
AGTPBP1Q9UPW5 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
AGTPBP1Q9UPW5 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
AGTPBP1Q9UPW5 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
AGTPBP1Q9UPW5 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
AGTPBP1Q9UPW5 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
AGTPBP1Q9UPW5 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
AGTPBP1Q9UPW5 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
AGTPBP1Q9UPW5 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
AGTPBP1Q9UPW5 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
AGTPBP1Q9UPW5 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
AGTPBP1Q9UPW5 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
AGTPBP1Q9UPW5 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
AGTPBP1Q9UPW5 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
AGTPBP1Q9UPW5 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
AGTPBP1Q9UPW5 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
AGTPBP1Q9UPW5 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
AGTPBP1Q9UPW5 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
AGTPBP1Q9UPW5 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
AGTPBP1Q9UPW5 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
AGTPBP1Q9UPW5 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
AGTPBP1Q9UPW5 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
AGTPBP1Q9UPW5 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
AGTPBP1Q9UPW5 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
AGTPBP1Q9UPW5 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
AGTPBP1Q9UPW5 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
AGTPBP1Q9UPW5 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
AGTPBP1Q9UPW5 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
AGTPBP1Q9UPW5 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
AGTPBP1Q9UPW5 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
AGTPBP1Q9UPW5 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
AGTPBP1Q9UPW5 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
AGTPBP1Q9UPW5 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
AGTPBP1Q9UPW5 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
AGTPBP1Q9UPW5 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
AGTPBP1Q9UPW5 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
AGTPBP1Q9UPW5 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
AGTPBP1Q9UPW5 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.8 ms