Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPT9

USP22, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 22, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP22Q9UPT9 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP22Q9UPT9 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP22Q9UPT9 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP22Q9UPT9 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP22Q9UPT9 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP22Q9UPT9 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP22Q9UPT9 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP22Q9UPT9 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP22Q9UPT9 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP22Q9UPT9 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP22Q9UPT9 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP22Q9UPT9 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
USP22Q9UPT9 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP22Q9UPT9 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP22Q9UPT9 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP22Q9UPT9 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP22Q9UPT9 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
USP22Q9UPT9 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP22Q9UPT9 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP22Q9UPT9 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP22Q9UPT9 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP22Q9UPT9 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP22Q9UPT9 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP22Q9UPT9 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP22Q9UPT9 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
USP22Q9UPT9 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP22Q9UPT9 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP22Q9UPT9 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP22Q9UPT9 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP22Q9UPT9 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
USP22Q9UPT9 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
USP22Q9UPT9 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
USP22Q9UPT9 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
USP22Q9UPT9 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP22Q9UPT9 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP22Q9UPT9 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP22Q9UPT9 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP22Q9UPT9 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP22Q9UPT9 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP22Q9UPT9 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP22Q9UPT9 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP22Q9UPT9 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP22Q9UPT9 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP22Q9UPT9 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP22Q9UPT9 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP22Q9UPT9 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP22Q9UPT9 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP22Q9UPT9 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
USP22Q9UPT9 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
USP22Q9UPT9 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
USP22Q9UPT9 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
USP22Q9UPT9 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
USP22Q9UPT9 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
USP22Q9UPT9 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
USP22Q9UPT9 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
USP22Q9UPT9 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
USP22Q9UPT9 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
USP22Q9UPT9 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
USP22Q9UPT9 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
USP22Q9UPT9 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
USP22Q9UPT9 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
USP22Q9UPT9 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
USP22Q9UPT9 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
USP22Q9UPT9 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
USP22Q9UPT9 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
USP22Q9UPT9 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
USP22Q9UPT9 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
USP22Q9UPT9 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
USP22Q9UPT9 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
USP22Q9UPT9 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
USP22Q9UPT9 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
USP22Q9UPT9 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
USP22Q9UPT9 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
USP22Q9UPT9 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
USP22Q9UPT9 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
USP22Q9UPT9 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
USP22Q9UPT9 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
USP22Q9UPT9 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
USP22Q9UPT9 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
USP22Q9UPT9 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
USP22Q9UPT9 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
USP22Q9UPT9 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
USP22Q9UPT9 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
USP22Q9UPT9 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
USP22Q9UPT9 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
USP22Q9UPT9 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
USP22Q9UPT9 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP22Q9UPT9 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
USP22Q9UPT9 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP22Q9UPT9 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP22Q9UPT9 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP22Q9UPT9 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP22Q9UPT9 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
USP22Q9UPT9 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP22Q9UPT9 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP22Q9UPT9 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP22Q9UPT9 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP22Q9UPT9 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP22Q9UPT9 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
USP22Q9UPT9 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms