Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMR5

PPT2, Lysosomal thioesterase PPT2, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPT2Q9UMR5 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PPT2Q9UMR5 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PPT2Q9UMR5 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PPT2Q9UMR5 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PPT2Q9UMR5 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PPT2Q9UMR5 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PPT2Q9UMR5 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PPT2Q9UMR5 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PPT2Q9UMR5 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PPT2Q9UMR5 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PPT2Q9UMR5 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PPT2Q9UMR5 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PPT2Q9UMR5 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PPT2Q9UMR5 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PPT2Q9UMR5 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PPT2Q9UMR5 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PPT2Q9UMR5 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PPT2Q9UMR5 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
PPT2Q9UMR5 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PPT2Q9UMR5 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPT2Q9UMR5 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPT2Q9UMR5 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPT2Q9UMR5 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPT2Q9UMR5 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PPT2Q9UMR5 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PPT2Q9UMR5 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PPT2Q9UMR5 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PPT2Q9UMR5 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PPT2Q9UMR5 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PPT2Q9UMR5 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PPT2Q9UMR5 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PPT2Q9UMR5 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PPT2Q9UMR5 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PPT2Q9UMR5 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PPT2Q9UMR5 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PPT2Q9UMR5 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PPT2Q9UMR5 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PPT2Q9UMR5 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PPT2Q9UMR5 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PPT2Q9UMR5 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PPT2Q9UMR5 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PPT2Q9UMR5 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PPT2Q9UMR5 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PPT2Q9UMR5 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PPT2Q9UMR5 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPT2Q9UMR5 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPT2Q9UMR5 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPT2Q9UMR5 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPT2Q9UMR5 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PPT2Q9UMR5 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PPT2Q9UMR5 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPT2Q9UMR5 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPT2Q9UMR5 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPT2Q9UMR5 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPT2Q9UMR5 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPT2Q9UMR5 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPT2Q9UMR5 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPT2Q9UMR5 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPT2Q9UMR5 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPT2Q9UMR5 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPT2Q9UMR5 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPT2Q9UMR5 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PPT2Q9UMR5 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPT2Q9UMR5 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPT2Q9UMR5 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPT2Q9UMR5 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPT2Q9UMR5 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPT2Q9UMR5 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPT2Q9UMR5 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPT2Q9UMR5 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPT2Q9UMR5 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPT2Q9UMR5 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPT2Q9UMR5 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PPT2Q9UMR5 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPT2Q9UMR5 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPT2Q9UMR5 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPT2Q9UMR5 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPT2Q9UMR5 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPT2Q9UMR5 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPT2Q9UMR5 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PPT2Q9UMR5 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPT2Q9UMR5 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPT2Q9UMR5 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPT2Q9UMR5 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPT2Q9UMR5 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPT2Q9UMR5 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPT2Q9UMR5 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPT2Q9UMR5 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPT2Q9UMR5 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPT2Q9UMR5 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPT2Q9UMR5 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPT2Q9UMR5 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPT2Q9UMR5 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPT2Q9UMR5 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPT2Q9UMR5 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPT2Q9UMR5 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPT2Q9UMR5 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PPT2Q9UMR5 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPT2Q9UMR5 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PPT2Q9UMR5 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms