Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM22

EPDR1, Mammalian ependymin-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPDR1Q9UM22 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
EPDR1Q9UM22 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
EPDR1Q9UM22 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
EPDR1Q9UM22 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
EPDR1Q9UM22 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
EPDR1Q9UM22 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
EPDR1Q9UM22 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
EPDR1Q9UM22 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
EPDR1Q9UM22 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EPDR1Q9UM22 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EPDR1Q9UM22 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EPDR1Q9UM22 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EPDR1Q9UM22 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EPDR1Q9UM22 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
EPDR1Q9UM22 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
EPDR1Q9UM22 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EPDR1Q9UM22 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EPDR1Q9UM22 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EPDR1Q9UM22 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
EPDR1Q9UM22 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EPDR1Q9UM22 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
EPDR1Q9UM22 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EPDR1Q9UM22 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EPDR1Q9UM22 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
EPDR1Q9UM22 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EPDR1Q9UM22 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
EPDR1Q9UM22 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EPDR1Q9UM22 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EPDR1Q9UM22 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
EPDR1Q9UM22 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
EPDR1Q9UM22 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EPDR1Q9UM22 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EPDR1Q9UM22 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EPDR1Q9UM22 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EPDR1Q9UM22 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EPDR1Q9UM22 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
EPDR1Q9UM22 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EPDR1Q9UM22 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EPDR1Q9UM22 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
EPDR1Q9UM22 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EPDR1Q9UM22 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EPDR1Q9UM22 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
EPDR1Q9UM22 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
EPDR1Q9UM22 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
EPDR1Q9UM22 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
EPDR1Q9UM22 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
EPDR1Q9UM22 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
EPDR1Q9UM22 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
EPDR1Q9UM22 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
EPDR1Q9UM22 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
EPDR1Q9UM22 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
EPDR1Q9UM22 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
EPDR1Q9UM22 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
EPDR1Q9UM22 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
EPDR1Q9UM22 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
EPDR1Q9UM22 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
EPDR1Q9UM22 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
EPDR1Q9UM22 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
EPDR1Q9UM22 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
EPDR1Q9UM22 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
EPDR1Q9UM22 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
EPDR1Q9UM22 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
EPDR1Q9UM22 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
EPDR1Q9UM22 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
EPDR1Q9UM22 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
EPDR1Q9UM22 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
EPDR1Q9UM22 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
EPDR1Q9UM22 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
EPDR1Q9UM22 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
EPDR1Q9UM22 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
EPDR1Q9UM22 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
EPDR1Q9UM22 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
EPDR1Q9UM22 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
EPDR1Q9UM22 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
EPDR1Q9UM22 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
EPDR1Q9UM22 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
EPDR1Q9UM22 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
EPDR1Q9UM22 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
EPDR1Q9UM22 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
EPDR1Q9UM22 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
EPDR1Q9UM22 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
EPDR1Q9UM22 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EPDR1Q9UM22 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
EPDR1Q9UM22 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
EPDR1Q9UM22 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EPDR1Q9UM22 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
EPDR1Q9UM22 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
EPDR1Q9UM22 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EPDR1Q9UM22 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EPDR1Q9UM22 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
EPDR1Q9UM22 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EPDR1Q9UM22 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EPDR1Q9UM22 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EPDR1Q9UM22 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
EPDR1Q9UM22 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EPDR1Q9UM22 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
EPDR1Q9UM22 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EPDR1Q9UM22 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
EPDR1Q9UM22 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
EPDR1Q9UM22 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 189.9 ms