Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKI3

VPREB3, Pre-B lymphocyte protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB3Q9UKI3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VPREB3Q9UKI3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VPREB3Q9UKI3 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
VPREB3Q9UKI3 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VPREB3Q9UKI3 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VPREB3Q9UKI3 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
VPREB3Q9UKI3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
VPREB3Q9UKI3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VPREB3Q9UKI3 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
VPREB3Q9UKI3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
VPREB3Q9UKI3 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
VPREB3Q9UKI3 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
VPREB3Q9UKI3 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
VPREB3Q9UKI3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VPREB3Q9UKI3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
VPREB3Q9UKI3 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VPREB3Q9UKI3 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
VPREB3Q9UKI3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VPREB3Q9UKI3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VPREB3Q9UKI3 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VPREB3Q9UKI3 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VPREB3Q9UKI3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VPREB3Q9UKI3 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
VPREB3Q9UKI3 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
VPREB3Q9UKI3 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
VPREB3Q9UKI3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
VPREB3Q9UKI3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
VPREB3Q9UKI3 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
VPREB3Q9UKI3 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
VPREB3Q9UKI3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
VPREB3Q9UKI3 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
VPREB3Q9UKI3 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
VPREB3Q9UKI3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
VPREB3Q9UKI3 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
VPREB3Q9UKI3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
VPREB3Q9UKI3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
VPREB3Q9UKI3 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
VPREB3Q9UKI3 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VPREB3Q9UKI3 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VPREB3Q9UKI3 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
VPREB3Q9UKI3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
VPREB3Q9UKI3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VPREB3Q9UKI3 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VPREB3Q9UKI3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
VPREB3Q9UKI3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VPREB3Q9UKI3 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VPREB3Q9UKI3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VPREB3Q9UKI3 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VPREB3Q9UKI3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VPREB3Q9UKI3 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
VPREB3Q9UKI3 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VPREB3Q9UKI3 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VPREB3Q9UKI3 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
VPREB3Q9UKI3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
VPREB3Q9UKI3 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
VPREB3Q9UKI3 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VPREB3Q9UKI3 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
VPREB3Q9UKI3 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
VPREB3Q9UKI3 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
VPREB3Q9UKI3 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VPREB3Q9UKI3 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
VPREB3Q9UKI3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
VPREB3Q9UKI3 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VPREB3Q9UKI3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VPREB3Q9UKI3 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VPREB3Q9UKI3 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
VPREB3Q9UKI3 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VPREB3Q9UKI3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VPREB3Q9UKI3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VPREB3Q9UKI3 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VPREB3Q9UKI3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VPREB3Q9UKI3 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
VPREB3Q9UKI3 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VPREB3Q9UKI3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VPREB3Q9UKI3 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VPREB3Q9UKI3 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VPREB3Q9UKI3 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VPREB3Q9UKI3 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
VPREB3Q9UKI3 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VPREB3Q9UKI3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VPREB3Q9UKI3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VPREB3Q9UKI3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VPREB3Q9UKI3 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VPREB3Q9UKI3 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VPREB3Q9UKI3 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VPREB3Q9UKI3 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VPREB3Q9UKI3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VPREB3Q9UKI3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VPREB3Q9UKI3 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VPREB3Q9UKI3 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VPREB3Q9UKI3 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VPREB3Q9UKI3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VPREB3Q9UKI3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VPREB3Q9UKI3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VPREB3Q9UKI3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VPREB3Q9UKI3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VPREB3Q9UKI3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VPREB3Q9UKI3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VPREB3Q9UKI3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VPREB3Q9UKI3 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms