Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKA2

FBXL4, F-box/LRR-repeat protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXL4Q9UKA2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FBXL4Q9UKA2 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FBXL4Q9UKA2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FBXL4Q9UKA2 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FBXL4Q9UKA2 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FBXL4Q9UKA2 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
FBXL4Q9UKA2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FBXL4Q9UKA2 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FBXL4Q9UKA2 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FBXL4Q9UKA2 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FBXL4Q9UKA2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FBXL4Q9UKA2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FBXL4Q9UKA2 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FBXL4Q9UKA2 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FBXL4Q9UKA2 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FBXL4Q9UKA2 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
FBXL4Q9UKA2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FBXL4Q9UKA2 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
FBXL4Q9UKA2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FBXL4Q9UKA2 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
FBXL4Q9UKA2 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FBXL4Q9UKA2 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FBXL4Q9UKA2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FBXL4Q9UKA2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FBXL4Q9UKA2 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FBXL4Q9UKA2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FBXL4Q9UKA2 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FBXL4Q9UKA2 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FBXL4Q9UKA2 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FBXL4Q9UKA2 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FBXL4Q9UKA2 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FBXL4Q9UKA2 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FBXL4Q9UKA2 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FBXL4Q9UKA2 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
FBXL4Q9UKA2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FBXL4Q9UKA2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FBXL4Q9UKA2 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FBXL4Q9UKA2 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FBXL4Q9UKA2 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FBXL4Q9UKA2 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FBXL4Q9UKA2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FBXL4Q9UKA2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FBXL4Q9UKA2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FBXL4Q9UKA2 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FBXL4Q9UKA2 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FBXL4Q9UKA2 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FBXL4Q9UKA2 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FBXL4Q9UKA2 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FBXL4Q9UKA2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
FBXL4Q9UKA2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FBXL4Q9UKA2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FBXL4Q9UKA2 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FBXL4Q9UKA2 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FBXL4Q9UKA2 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FBXL4Q9UKA2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FBXL4Q9UKA2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FBXL4Q9UKA2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FBXL4Q9UKA2 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FBXL4Q9UKA2 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FBXL4Q9UKA2 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FBXL4Q9UKA2 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FBXL4Q9UKA2 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
FBXL4Q9UKA2 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FBXL4Q9UKA2 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FBXL4Q9UKA2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FBXL4Q9UKA2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FBXL4Q9UKA2 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FBXL4Q9UKA2 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FBXL4Q9UKA2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FBXL4Q9UKA2 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FBXL4Q9UKA2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FBXL4Q9UKA2 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FBXL4Q9UKA2 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FBXL4Q9UKA2 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FBXL4Q9UKA2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FBXL4Q9UKA2 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FBXL4Q9UKA2 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FBXL4Q9UKA2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FBXL4Q9UKA2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FBXL4Q9UKA2 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FBXL4Q9UKA2 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FBXL4Q9UKA2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FBXL4Q9UKA2 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FBXL4Q9UKA2 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FBXL4Q9UKA2 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FBXL4Q9UKA2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FBXL4Q9UKA2 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FBXL4Q9UKA2 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FBXL4Q9UKA2 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
FBXL4Q9UKA2 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
FBXL4Q9UKA2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FBXL4Q9UKA2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FBXL4Q9UKA2 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FBXL4Q9UKA2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FBXL4Q9UKA2 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FBXL4Q9UKA2 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FBXL4Q9UKA2 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FBXL4Q9UKA2 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
FBXL4Q9UKA2 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FBXL4Q9UKA2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms