Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK80

USP21, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 21, humanhuman

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP21Q9UK80 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
USP21Q9UK80 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
USP21Q9UK80 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
USP21Q9UK80 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC34.64■■■■□ 3.14
USP21Q9UK80 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.14
USP21Q9UK80 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
USP21Q9UK80 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
USP21Q9UK80 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
USP21Q9UK80 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC34.63■■■■□ 3.13
USP21Q9UK80 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
USP21Q9UK80 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC34.61■■■■□ 3.13
USP21Q9UK80 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
USP21Q9UK80 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
USP21Q9UK80 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
USP21Q9UK80 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
USP21Q9UK80 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
USP21Q9UK80 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
USP21Q9UK80 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
USP21Q9UK80 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC34.59■■■■□ 3.13
USP21Q9UK80 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
USP21Q9UK80 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
USP21Q9UK80 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC34.57■■■■□ 3.13
USP21Q9UK80 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC34.57■■■■□ 3.12
USP21Q9UK80 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC34.57■■■■□ 3.12
USP21Q9UK80 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
USP21Q9UK80 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
USP21Q9UK80 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
USP21Q9UK80 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
USP21Q9UK80 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC34.56■■■■□ 3.12
USP21Q9UK80 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
USP21Q9UK80 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
USP21Q9UK80 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
USP21Q9UK80 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
USP21Q9UK80 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
USP21Q9UK80 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
USP21Q9UK80 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
USP21Q9UK80 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
USP21Q9UK80 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
USP21Q9UK80 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
USP21Q9UK80 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
USP21Q9UK80 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
USP21Q9UK80 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
USP21Q9UK80 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
USP21Q9UK80 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
USP21Q9UK80 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC34.52■■■■□ 3.12
USP21Q9UK80 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.12
USP21Q9UK80 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC34.51■■■■□ 3.12
USP21Q9UK80 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC34.51■■■■□ 3.12
USP21Q9UK80 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC34.51■■■■□ 3.12
USP21Q9UK80 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
USP21Q9UK80 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
USP21Q9UK80 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
USP21Q9UK80 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.5■■■■□ 3.11
USP21Q9UK80 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC34.49■■■■□ 3.11
USP21Q9UK80 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
USP21Q9UK80 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
USP21Q9UK80 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
USP21Q9UK80 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
USP21Q9UK80 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
USP21Q9UK80 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
USP21Q9UK80 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC34.47■■■■□ 3.11
USP21Q9UK80 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
USP21Q9UK80 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
USP21Q9UK80 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
USP21Q9UK80 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
USP21Q9UK80 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
USP21Q9UK80 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
USP21Q9UK80 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
USP21Q9UK80 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
USP21Q9UK80 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC34.45■■■■□ 3.11
USP21Q9UK80 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
USP21Q9UK80 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
USP21Q9UK80 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
USP21Q9UK80 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
USP21Q9UK80 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
USP21Q9UK80 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.43■■■■□ 3.1
USP21Q9UK80 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
USP21Q9UK80 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
USP21Q9UK80 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC34.43■■■■□ 3.1
USP21Q9UK80 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
USP21Q9UK80 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
USP21Q9UK80 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
USP21Q9UK80 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
USP21Q9UK80 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
USP21Q9UK80 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
USP21Q9UK80 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
USP21Q9UK80 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
USP21Q9UK80 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
USP21Q9UK80 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
USP21Q9UK80 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
USP21Q9UK80 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
USP21Q9UK80 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
USP21Q9UK80 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
USP21Q9UK80 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
USP21Q9UK80 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
USP21Q9UK80 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
USP21Q9UK80 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
USP21Q9UK80 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
USP21Q9UK80 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
USP21Q9UK80 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms