Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW0

VAX2, Ventral anterior homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAX2Q9UIW0 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
VAX2Q9UIW0 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
VAX2Q9UIW0 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
VAX2Q9UIW0 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
VAX2Q9UIW0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
VAX2Q9UIW0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
VAX2Q9UIW0 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
VAX2Q9UIW0 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
VAX2Q9UIW0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
VAX2Q9UIW0 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
VAX2Q9UIW0 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
VAX2Q9UIW0 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
VAX2Q9UIW0 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
VAX2Q9UIW0 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
VAX2Q9UIW0 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
VAX2Q9UIW0 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
VAX2Q9UIW0 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
VAX2Q9UIW0 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
VAX2Q9UIW0 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
VAX2Q9UIW0 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
VAX2Q9UIW0 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
VAX2Q9UIW0 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
VAX2Q9UIW0 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
VAX2Q9UIW0 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
VAX2Q9UIW0 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
VAX2Q9UIW0 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
VAX2Q9UIW0 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
VAX2Q9UIW0 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
VAX2Q9UIW0 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
VAX2Q9UIW0 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
VAX2Q9UIW0 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
VAX2Q9UIW0 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
VAX2Q9UIW0 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
VAX2Q9UIW0 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
VAX2Q9UIW0 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
VAX2Q9UIW0 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
VAX2Q9UIW0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
VAX2Q9UIW0 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
VAX2Q9UIW0 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
VAX2Q9UIW0 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
VAX2Q9UIW0 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
VAX2Q9UIW0 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
VAX2Q9UIW0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
VAX2Q9UIW0 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
VAX2Q9UIW0 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
VAX2Q9UIW0 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
VAX2Q9UIW0 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
VAX2Q9UIW0 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
VAX2Q9UIW0 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
VAX2Q9UIW0 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
VAX2Q9UIW0 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
VAX2Q9UIW0 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
VAX2Q9UIW0 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
VAX2Q9UIW0 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
VAX2Q9UIW0 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
VAX2Q9UIW0 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
VAX2Q9UIW0 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
VAX2Q9UIW0 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
VAX2Q9UIW0 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
VAX2Q9UIW0 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
VAX2Q9UIW0 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
VAX2Q9UIW0 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
VAX2Q9UIW0 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
VAX2Q9UIW0 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
VAX2Q9UIW0 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
VAX2Q9UIW0 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
VAX2Q9UIW0 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
VAX2Q9UIW0 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
VAX2Q9UIW0 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
VAX2Q9UIW0 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
VAX2Q9UIW0 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
VAX2Q9UIW0 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
VAX2Q9UIW0 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
VAX2Q9UIW0 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
VAX2Q9UIW0 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
VAX2Q9UIW0 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
VAX2Q9UIW0 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
VAX2Q9UIW0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
VAX2Q9UIW0 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
VAX2Q9UIW0 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
VAX2Q9UIW0 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
VAX2Q9UIW0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
VAX2Q9UIW0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
VAX2Q9UIW0 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
VAX2Q9UIW0 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
VAX2Q9UIW0 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
VAX2Q9UIW0 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
VAX2Q9UIW0 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
VAX2Q9UIW0 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
VAX2Q9UIW0 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
VAX2Q9UIW0 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
VAX2Q9UIW0 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
VAX2Q9UIW0 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
VAX2Q9UIW0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
VAX2Q9UIW0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
VAX2Q9UIW0 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
VAX2Q9UIW0 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
VAX2Q9UIW0 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
VAX2Q9UIW0 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
VAX2Q9UIW0 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms