Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHV7

MED13, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13, humanhuman

Predictions only

Length 2,174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED13Q9UHV7 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MED13Q9UHV7 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MED13Q9UHV7 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MED13Q9UHV7 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MED13Q9UHV7 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
MED13Q9UHV7 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MED13Q9UHV7 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MED13Q9UHV7 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MED13Q9UHV7 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
MED13Q9UHV7 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MED13Q9UHV7 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MED13Q9UHV7 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MED13Q9UHV7 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MED13Q9UHV7 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MED13Q9UHV7 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MED13Q9UHV7 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MED13Q9UHV7 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MED13Q9UHV7 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MED13Q9UHV7 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MED13Q9UHV7 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MED13Q9UHV7 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MED13Q9UHV7 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MED13Q9UHV7 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MED13Q9UHV7 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MED13Q9UHV7 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
MED13Q9UHV7 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MED13Q9UHV7 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MED13Q9UHV7 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MED13Q9UHV7 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MED13Q9UHV7 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MED13Q9UHV7 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MED13Q9UHV7 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MED13Q9UHV7 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MED13Q9UHV7 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
MED13Q9UHV7 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
MED13Q9UHV7 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MED13Q9UHV7 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MED13Q9UHV7 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MED13Q9UHV7 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MED13Q9UHV7 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MED13Q9UHV7 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MED13Q9UHV7 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MED13Q9UHV7 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MED13Q9UHV7 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MED13Q9UHV7 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MED13Q9UHV7 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MED13Q9UHV7 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MED13Q9UHV7 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MED13Q9UHV7 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MED13Q9UHV7 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MED13Q9UHV7 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MED13Q9UHV7 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MED13Q9UHV7 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MED13Q9UHV7 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MED13Q9UHV7 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MED13Q9UHV7 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MED13Q9UHV7 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MED13Q9UHV7 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MED13Q9UHV7 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MED13Q9UHV7 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
MED13Q9UHV7 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MED13Q9UHV7 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
MED13Q9UHV7 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MED13Q9UHV7 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MED13Q9UHV7 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
MED13Q9UHV7 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MED13Q9UHV7 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MED13Q9UHV7 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MED13Q9UHV7 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MED13Q9UHV7 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MED13Q9UHV7 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
MED13Q9UHV7 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MED13Q9UHV7 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MED13Q9UHV7 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MED13Q9UHV7 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MED13Q9UHV7 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MED13Q9UHV7 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MED13Q9UHV7 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MED13Q9UHV7 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MED13Q9UHV7 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MED13Q9UHV7 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
MED13Q9UHV7 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MED13Q9UHV7 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MED13Q9UHV7 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
MED13Q9UHV7 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
MED13Q9UHV7 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MED13Q9UHV7 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MED13Q9UHV7 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MED13Q9UHV7 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MED13Q9UHV7 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MED13Q9UHV7 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MED13Q9UHV7 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MED13Q9UHV7 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MED13Q9UHV7 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
MED13Q9UHV7 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MED13Q9UHV7 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MED13Q9UHV7 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
MED13Q9UHV7 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MED13Q9UHV7 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MED13Q9UHV7 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms