Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHI7

SLC23A1, Solute carrier family 23 member 1, humanhuman

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC23A1Q9UHI7 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC23A1Q9UHI7 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC23A1Q9UHI7 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC23A1Q9UHI7 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC23A1Q9UHI7 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC23A1Q9UHI7 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC23A1Q9UHI7 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC23A1Q9UHI7 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC23A1Q9UHI7 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC23A1Q9UHI7 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC23A1Q9UHI7 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC23A1Q9UHI7 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC23A1Q9UHI7 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC23A1Q9UHI7 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC23A1Q9UHI7 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC23A1Q9UHI7 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC23A1Q9UHI7 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC23A1Q9UHI7 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC23A1Q9UHI7 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC23A1Q9UHI7 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC23A1Q9UHI7 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC23A1Q9UHI7 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC23A1Q9UHI7 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC23A1Q9UHI7 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC23A1Q9UHI7 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC23A1Q9UHI7 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC23A1Q9UHI7 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC23A1Q9UHI7 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC23A1Q9UHI7 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC23A1Q9UHI7 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC23A1Q9UHI7 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC23A1Q9UHI7 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC23A1Q9UHI7 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC23A1Q9UHI7 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC23A1Q9UHI7 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC23A1Q9UHI7 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC23A1Q9UHI7 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC23A1Q9UHI7 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC23A1Q9UHI7 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC23A1Q9UHI7 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC23A1Q9UHI7 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC23A1Q9UHI7 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC23A1Q9UHI7 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC23A1Q9UHI7 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC23A1Q9UHI7 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC23A1Q9UHI7 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC23A1Q9UHI7 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC23A1Q9UHI7 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC23A1Q9UHI7 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC23A1Q9UHI7 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC23A1Q9UHI7 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC23A1Q9UHI7 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC23A1Q9UHI7 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC23A1Q9UHI7 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC23A1Q9UHI7 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC23A1Q9UHI7 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC23A1Q9UHI7 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC23A1Q9UHI7 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC23A1Q9UHI7 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC23A1Q9UHI7 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC23A1Q9UHI7 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC23A1Q9UHI7 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC23A1Q9UHI7 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC23A1Q9UHI7 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC23A1Q9UHI7 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC23A1Q9UHI7 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC23A1Q9UHI7 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC23A1Q9UHI7 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC23A1Q9UHI7 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC23A1Q9UHI7 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC23A1Q9UHI7 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC23A1Q9UHI7 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC23A1Q9UHI7 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC23A1Q9UHI7 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC23A1Q9UHI7 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC23A1Q9UHI7 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC23A1Q9UHI7 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC23A1Q9UHI7 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC23A1Q9UHI7 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC23A1Q9UHI7 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC23A1Q9UHI7 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC23A1Q9UHI7 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC23A1Q9UHI7 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC23A1Q9UHI7 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC23A1Q9UHI7 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC23A1Q9UHI7 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC23A1Q9UHI7 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC23A1Q9UHI7 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC23A1Q9UHI7 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC23A1Q9UHI7 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC23A1Q9UHI7 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC23A1Q9UHI7 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC23A1Q9UHI7 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC23A1Q9UHI7 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC23A1Q9UHI7 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC23A1Q9UHI7 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC23A1Q9UHI7 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC23A1Q9UHI7 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC23A1Q9UHI7 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC23A1Q9UHI7 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms