Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD1

CHORDC1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHORDC1Q9UHD1 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CHORDC1Q9UHD1 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
CHORDC1Q9UHD1 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CHORDC1Q9UHD1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CHORDC1Q9UHD1 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CHORDC1Q9UHD1 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CHORDC1Q9UHD1 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CHORDC1Q9UHD1 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CHORDC1Q9UHD1 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
CHORDC1Q9UHD1 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CHORDC1Q9UHD1 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CHORDC1Q9UHD1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CHORDC1Q9UHD1 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
CHORDC1Q9UHD1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CHORDC1Q9UHD1 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CHORDC1Q9UHD1 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CHORDC1Q9UHD1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CHORDC1Q9UHD1 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CHORDC1Q9UHD1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CHORDC1Q9UHD1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CHORDC1Q9UHD1 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CHORDC1Q9UHD1 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CHORDC1Q9UHD1 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CHORDC1Q9UHD1 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CHORDC1Q9UHD1 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CHORDC1Q9UHD1 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CHORDC1Q9UHD1 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CHORDC1Q9UHD1 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CHORDC1Q9UHD1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CHORDC1Q9UHD1 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CHORDC1Q9UHD1 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CHORDC1Q9UHD1 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CHORDC1Q9UHD1 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CHORDC1Q9UHD1 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CHORDC1Q9UHD1 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
CHORDC1Q9UHD1 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
CHORDC1Q9UHD1 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
CHORDC1Q9UHD1 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
CHORDC1Q9UHD1 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
CHORDC1Q9UHD1 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
CHORDC1Q9UHD1 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
CHORDC1Q9UHD1 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
CHORDC1Q9UHD1 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
CHORDC1Q9UHD1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CHORDC1Q9UHD1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CHORDC1Q9UHD1 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CHORDC1Q9UHD1 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CHORDC1Q9UHD1 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CHORDC1Q9UHD1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CHORDC1Q9UHD1 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CHORDC1Q9UHD1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CHORDC1Q9UHD1 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CHORDC1Q9UHD1 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CHORDC1Q9UHD1 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CHORDC1Q9UHD1 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CHORDC1Q9UHD1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CHORDC1Q9UHD1 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CHORDC1Q9UHD1 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CHORDC1Q9UHD1 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CHORDC1Q9UHD1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CHORDC1Q9UHD1 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CHORDC1Q9UHD1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CHORDC1Q9UHD1 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CHORDC1Q9UHD1 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
CHORDC1Q9UHD1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CHORDC1Q9UHD1 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CHORDC1Q9UHD1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHORDC1Q9UHD1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHORDC1Q9UHD1 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHORDC1Q9UHD1 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHORDC1Q9UHD1 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHORDC1Q9UHD1 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHORDC1Q9UHD1 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CHORDC1Q9UHD1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHORDC1Q9UHD1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CHORDC1Q9UHD1 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CHORDC1Q9UHD1 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CHORDC1Q9UHD1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CHORDC1Q9UHD1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CHORDC1Q9UHD1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CHORDC1Q9UHD1 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CHORDC1Q9UHD1 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CHORDC1Q9UHD1 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CHORDC1Q9UHD1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CHORDC1Q9UHD1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CHORDC1Q9UHD1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CHORDC1Q9UHD1 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CHORDC1Q9UHD1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CHORDC1Q9UHD1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CHORDC1Q9UHD1 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CHORDC1Q9UHD1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CHORDC1Q9UHD1 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CHORDC1Q9UHD1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CHORDC1Q9UHD1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CHORDC1Q9UHD1 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CHORDC1Q9UHD1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CHORDC1Q9UHD1 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CHORDC1Q9UHD1 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CHORDC1Q9UHD1 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CHORDC1Q9UHD1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms