Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHB7

AFF4, AF4/FMR2 family member 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFF4Q9UHB7 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
AFF4Q9UHB7 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
AFF4Q9UHB7 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27■■□□□ 1.91
AFF4Q9UHB7 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
AFF4Q9UHB7 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
AFF4Q9UHB7 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27■■□□□ 1.91
AFF4Q9UHB7 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
AFF4Q9UHB7 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
AFF4Q9UHB7 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
AFF4Q9UHB7 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
AFF4Q9UHB7 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
AFF4Q9UHB7 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
AFF4Q9UHB7 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
AFF4Q9UHB7 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
AFF4Q9UHB7 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
AFF4Q9UHB7 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
AFF4Q9UHB7 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
AFF4Q9UHB7 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
AFF4Q9UHB7 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
AFF4Q9UHB7 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
AFF4Q9UHB7 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
AFF4Q9UHB7 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
AFF4Q9UHB7 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
AFF4Q9UHB7 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
AFF4Q9UHB7 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
AFF4Q9UHB7 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
AFF4Q9UHB7 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
AFF4Q9UHB7 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
AFF4Q9UHB7 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
AFF4Q9UHB7 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
AFF4Q9UHB7 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
AFF4Q9UHB7 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
AFF4Q9UHB7 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
AFF4Q9UHB7 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
AFF4Q9UHB7 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
AFF4Q9UHB7 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
AFF4Q9UHB7 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
AFF4Q9UHB7 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
AFF4Q9UHB7 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
AFF4Q9UHB7 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
AFF4Q9UHB7 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
AFF4Q9UHB7 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
AFF4Q9UHB7 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
AFF4Q9UHB7 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
AFF4Q9UHB7 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
AFF4Q9UHB7 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
AFF4Q9UHB7 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
AFF4Q9UHB7 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
AFF4Q9UHB7 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
AFF4Q9UHB7 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
AFF4Q9UHB7 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
AFF4Q9UHB7 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
AFF4Q9UHB7 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
AFF4Q9UHB7 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
AFF4Q9UHB7 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
AFF4Q9UHB7 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
AFF4Q9UHB7 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
AFF4Q9UHB7 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
AFF4Q9UHB7 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
AFF4Q9UHB7 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
AFF4Q9UHB7 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
AFF4Q9UHB7 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
AFF4Q9UHB7 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
AFF4Q9UHB7 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
AFF4Q9UHB7 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
AFF4Q9UHB7 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
AFF4Q9UHB7 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
AFF4Q9UHB7 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
AFF4Q9UHB7 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
AFF4Q9UHB7 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
AFF4Q9UHB7 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
AFF4Q9UHB7 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
AFF4Q9UHB7 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
AFF4Q9UHB7 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
AFF4Q9UHB7 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
AFF4Q9UHB7 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
AFF4Q9UHB7 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
AFF4Q9UHB7 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
AFF4Q9UHB7 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
AFF4Q9UHB7 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
AFF4Q9UHB7 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
AFF4Q9UHB7 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
AFF4Q9UHB7 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
AFF4Q9UHB7 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
AFF4Q9UHB7 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
AFF4Q9UHB7 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
AFF4Q9UHB7 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
AFF4Q9UHB7 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
AFF4Q9UHB7 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
AFF4Q9UHB7 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
AFF4Q9UHB7 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
AFF4Q9UHB7 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
AFF4Q9UHB7 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
AFF4Q9UHB7 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
AFF4Q9UHB7 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
AFF4Q9UHB7 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
AFF4Q9UHB7 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
AFF4Q9UHB7 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
AFF4Q9UHB7 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
AFF4Q9UHB7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 137.1 ms