Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH90

FBXO40, F-box only protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO40Q9UH90 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
FBXO40Q9UH90 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
FBXO40Q9UH90 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
FBXO40Q9UH90 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
FBXO40Q9UH90 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
FBXO40Q9UH90 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
FBXO40Q9UH90 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
FBXO40Q9UH90 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
FBXO40Q9UH90 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
FBXO40Q9UH90 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
FBXO40Q9UH90 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
FBXO40Q9UH90 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
FBXO40Q9UH90 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
FBXO40Q9UH90 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
FBXO40Q9UH90 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
FBXO40Q9UH90 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
FBXO40Q9UH90 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
FBXO40Q9UH90 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
FBXO40Q9UH90 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
FBXO40Q9UH90 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
FBXO40Q9UH90 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
FBXO40Q9UH90 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
FBXO40Q9UH90 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
FBXO40Q9UH90 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
FBXO40Q9UH90 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
FBXO40Q9UH90 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
FBXO40Q9UH90 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
FBXO40Q9UH90 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
FBXO40Q9UH90 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
FBXO40Q9UH90 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
FBXO40Q9UH90 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
FBXO40Q9UH90 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
FBXO40Q9UH90 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
FBXO40Q9UH90 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
FBXO40Q9UH90 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
FBXO40Q9UH90 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
FBXO40Q9UH90 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
FBXO40Q9UH90 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
FBXO40Q9UH90 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
FBXO40Q9UH90 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
FBXO40Q9UH90 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
FBXO40Q9UH90 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
FBXO40Q9UH90 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
FBXO40Q9UH90 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
FBXO40Q9UH90 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
FBXO40Q9UH90 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
FBXO40Q9UH90 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
FBXO40Q9UH90 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
FBXO40Q9UH90 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
FBXO40Q9UH90 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
FBXO40Q9UH90 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
FBXO40Q9UH90 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
FBXO40Q9UH90 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
FBXO40Q9UH90 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
FBXO40Q9UH90 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
FBXO40Q9UH90 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
FBXO40Q9UH90 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
FBXO40Q9UH90 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
FBXO40Q9UH90 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
FBXO40Q9UH90 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
FBXO40Q9UH90 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
FBXO40Q9UH90 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
FBXO40Q9UH90 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
FBXO40Q9UH90 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
FBXO40Q9UH90 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
FBXO40Q9UH90 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
FBXO40Q9UH90 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
FBXO40Q9UH90 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
FBXO40Q9UH90 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
FBXO40Q9UH90 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
FBXO40Q9UH90 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
FBXO40Q9UH90 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
FBXO40Q9UH90 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
FBXO40Q9UH90 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
FBXO40Q9UH90 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
FBXO40Q9UH90 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
FBXO40Q9UH90 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
FBXO40Q9UH90 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC29■■■□□ 2.23
FBXO40Q9UH90 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
FBXO40Q9UH90 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
FBXO40Q9UH90 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
FBXO40Q9UH90 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
FBXO40Q9UH90 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
FBXO40Q9UH90 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
FBXO40Q9UH90 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
FBXO40Q9UH90 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
FBXO40Q9UH90 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
FBXO40Q9UH90 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
FBXO40Q9UH90 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
FBXO40Q9UH90 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
FBXO40Q9UH90 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
FBXO40Q9UH90 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
FBXO40Q9UH90 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
FBXO40Q9UH90 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
FBXO40Q9UH90 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
FBXO40Q9UH90 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
FBXO40Q9UH90 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
FBXO40Q9UH90 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
FBXO40Q9UH90 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
FBXO40Q9UH90 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms