Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFD9

RIMBP3, RIMS-binding protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 1,639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMBP3Q9UFD9 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.13■■■■■ 4.34
RIMBP3Q9UFD9 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC42.13■■■■■ 4.33
RIMBP3Q9UFD9 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.13■■■■■ 4.33
RIMBP3Q9UFD9 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC42.12■■■■■ 4.33
RIMBP3Q9UFD9 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC42.11■■■■■ 4.33
RIMBP3Q9UFD9 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC42.11■■■■■ 4.33
RIMBP3Q9UFD9 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC42.11■■■■■ 4.33
RIMBP3Q9UFD9 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC42.11■■■■■ 4.33
RIMBP3Q9UFD9 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.1■■■■■ 4.33
RIMBP3Q9UFD9 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC42.09■■■■■ 4.33
RIMBP3Q9UFD9 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC42.08■■■■■ 4.33
RIMBP3Q9UFD9 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC42.08■■■■■ 4.33
RIMBP3Q9UFD9 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.07■■■■■ 4.33
RIMBP3Q9UFD9 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC42.06■■■■■ 4.32
RIMBP3Q9UFD9 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC42.06■■■■■ 4.32
RIMBP3Q9UFD9 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC42.06■■■■■ 4.32
RIMBP3Q9UFD9 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.06■■■■■ 4.32
RIMBP3Q9UFD9 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC42.06■■■■■ 4.32
RIMBP3Q9UFD9 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.06■■■■■ 4.32
RIMBP3Q9UFD9 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.06■■■■■ 4.32
RIMBP3Q9UFD9 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.06■■■■■ 4.32
RIMBP3Q9UFD9 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.03■■■■■ 4.32
RIMBP3Q9UFD9 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC42.02■■■■■ 4.32
RIMBP3Q9UFD9 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC42.02■■■■■ 4.32
RIMBP3Q9UFD9 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4.31
RIMBP3Q9UFD9 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42■■■■■ 4.31
RIMBP3Q9UFD9 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4.31
RIMBP3Q9UFD9 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC42■■■■■ 4.31
RIMBP3Q9UFD9 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC41.99■■■■■ 4.31
RIMBP3Q9UFD9 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC41.98■■■■■ 4.31
RIMBP3Q9UFD9 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.98■■■■■ 4.31
RIMBP3Q9UFD9 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC41.98■■■■■ 4.31
RIMBP3Q9UFD9 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.96■■■■■ 4.31
RIMBP3Q9UFD9 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC41.96■■■■■ 4.31
RIMBP3Q9UFD9 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC41.96■■■■■ 4.31
RIMBP3Q9UFD9 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.96■■■■■ 4.31
RIMBP3Q9UFD9 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC41.95■■■■■ 4.31
RIMBP3Q9UFD9 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC41.95■■■■■ 4.31
RIMBP3Q9UFD9 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.95■■■■■ 4.31
RIMBP3Q9UFD9 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC41.94■■■■■ 4.3
RIMBP3Q9UFD9 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.93■■■■■ 4.3
RIMBP3Q9UFD9 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.93■■■■■ 4.3
RIMBP3Q9UFD9 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC41.93■■■■■ 4.3
RIMBP3Q9UFD9 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.93■■■■■ 4.3
RIMBP3Q9UFD9 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC41.92■■■■■ 4.3
RIMBP3Q9UFD9 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC41.92■■■■■ 4.3
RIMBP3Q9UFD9 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC41.92■■■■■ 4.3
RIMBP3Q9UFD9 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.91■■■■■ 4.3
RIMBP3Q9UFD9 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC41.9■■■■■ 4.3
RIMBP3Q9UFD9 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC41.9■■■■■ 4.3
RIMBP3Q9UFD9 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC41.9■■■■■ 4.3
RIMBP3Q9UFD9 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC41.89■■■■■ 4.3
RIMBP3Q9UFD9 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.89■■■■■ 4.3
RIMBP3Q9UFD9 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC41.88■■■■■ 4.3
RIMBP3Q9UFD9 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.87■■■■■ 4.29
RIMBP3Q9UFD9 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC41.87■■■■■ 4.29
RIMBP3Q9UFD9 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC41.87■■■■■ 4.29
RIMBP3Q9UFD9 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.87■■■■■ 4.29
RIMBP3Q9UFD9 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.86■■■■■ 4.29
RIMBP3Q9UFD9 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.84■■■■■ 4.29
RIMBP3Q9UFD9 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.84■■■■■ 4.29
RIMBP3Q9UFD9 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.81■■■■■ 4.28
RIMBP3Q9UFD9 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC41.81■■■■■ 4.28
RIMBP3Q9UFD9 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC41.8■■■■■ 4.28
RIMBP3Q9UFD9 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.79■■■■■ 4.28
RIMBP3Q9UFD9 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC41.79■■■■■ 4.28
RIMBP3Q9UFD9 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.79■■■■■ 4.28
RIMBP3Q9UFD9 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.79■■■■■ 4.28
RIMBP3Q9UFD9 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC41.79■■■■■ 4.28
RIMBP3Q9UFD9 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC41.78■■■■■ 4.28
RIMBP3Q9UFD9 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.78■■■■■ 4.28
RIMBP3Q9UFD9 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC41.77■■■■■ 4.28
RIMBP3Q9UFD9 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC41.77■■■■■ 4.28
RIMBP3Q9UFD9 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC41.77■■■■■ 4.28
RIMBP3Q9UFD9 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC41.77■■■■■ 4.28
RIMBP3Q9UFD9 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC41.77■■■■■ 4.28
RIMBP3Q9UFD9 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.76■■■■■ 4.28
RIMBP3Q9UFD9 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC41.76■■■■■ 4.28
RIMBP3Q9UFD9 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.76■■■■■ 4.28
RIMBP3Q9UFD9 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.74■■■■■ 4.27
RIMBP3Q9UFD9 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC41.74■■■■■ 4.27
RIMBP3Q9UFD9 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC41.74■■■■■ 4.27
RIMBP3Q9UFD9 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.73■■■■■ 4.27
RIMBP3Q9UFD9 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC41.73■■■■■ 4.27
RIMBP3Q9UFD9 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.73■■■■■ 4.27
RIMBP3Q9UFD9 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC41.73■■■■■ 4.27
RIMBP3Q9UFD9 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC41.73■■■■■ 4.27
RIMBP3Q9UFD9 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC41.72■■■■■ 4.27
RIMBP3Q9UFD9 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC41.72■■■■■ 4.27
RIMBP3Q9UFD9 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC41.72■■■■■ 4.27
RIMBP3Q9UFD9 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC41.72■■■■■ 4.27
RIMBP3Q9UFD9 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC41.72■■■■■ 4.27
RIMBP3Q9UFD9 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC41.72■■■■■ 4.27
RIMBP3Q9UFD9 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.71■■■■■ 4.27
RIMBP3Q9UFD9 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC41.71■■■■■ 4.27
RIMBP3Q9UFD9 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC41.71■■■■■ 4.27
RIMBP3Q9UFD9 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.7■■■■■ 4.27
RIMBP3Q9UFD9 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC41.7■■■■■ 4.27
RIMBP3Q9UFD9 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.7■■■■■ 4.27
RIMBP3Q9UFD9 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.69■■■■■ 4.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.7 ms