Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDT6

CLIP2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP2Q9UDT6 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CLIP2Q9UDT6 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
CLIP2Q9UDT6 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CLIP2Q9UDT6 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CLIP2Q9UDT6 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CLIP2Q9UDT6 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CLIP2Q9UDT6 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CLIP2Q9UDT6 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CLIP2Q9UDT6 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CLIP2Q9UDT6 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CLIP2Q9UDT6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CLIP2Q9UDT6 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CLIP2Q9UDT6 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CLIP2Q9UDT6 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CLIP2Q9UDT6 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
CLIP2Q9UDT6 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CLIP2Q9UDT6 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
CLIP2Q9UDT6 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
CLIP2Q9UDT6 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CLIP2Q9UDT6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CLIP2Q9UDT6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CLIP2Q9UDT6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CLIP2Q9UDT6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CLIP2Q9UDT6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CLIP2Q9UDT6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CLIP2Q9UDT6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CLIP2Q9UDT6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CLIP2Q9UDT6 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC30■■■□□ 2.39
CLIP2Q9UDT6 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
CLIP2Q9UDT6 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CLIP2Q9UDT6 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
CLIP2Q9UDT6 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CLIP2Q9UDT6 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CLIP2Q9UDT6 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CLIP2Q9UDT6 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CLIP2Q9UDT6 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CLIP2Q9UDT6 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CLIP2Q9UDT6 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CLIP2Q9UDT6 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CLIP2Q9UDT6 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CLIP2Q9UDT6 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CLIP2Q9UDT6 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CLIP2Q9UDT6 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CLIP2Q9UDT6 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
CLIP2Q9UDT6 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
CLIP2Q9UDT6 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
CLIP2Q9UDT6 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
CLIP2Q9UDT6 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
CLIP2Q9UDT6 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
CLIP2Q9UDT6 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
CLIP2Q9UDT6 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CLIP2Q9UDT6 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CLIP2Q9UDT6 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CLIP2Q9UDT6 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CLIP2Q9UDT6 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CLIP2Q9UDT6 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CLIP2Q9UDT6 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CLIP2Q9UDT6 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CLIP2Q9UDT6 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CLIP2Q9UDT6 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
CLIP2Q9UDT6 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CLIP2Q9UDT6 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CLIP2Q9UDT6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CLIP2Q9UDT6 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CLIP2Q9UDT6 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CLIP2Q9UDT6 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
CLIP2Q9UDT6 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CLIP2Q9UDT6 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CLIP2Q9UDT6 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CLIP2Q9UDT6 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CLIP2Q9UDT6 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CLIP2Q9UDT6 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CLIP2Q9UDT6 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CLIP2Q9UDT6 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CLIP2Q9UDT6 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CLIP2Q9UDT6 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CLIP2Q9UDT6 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CLIP2Q9UDT6 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CLIP2Q9UDT6 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CLIP2Q9UDT6 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CLIP2Q9UDT6 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CLIP2Q9UDT6 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CLIP2Q9UDT6 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CLIP2Q9UDT6 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CLIP2Q9UDT6 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CLIP2Q9UDT6 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CLIP2Q9UDT6 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CLIP2Q9UDT6 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CLIP2Q9UDT6 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CLIP2Q9UDT6 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CLIP2Q9UDT6 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CLIP2Q9UDT6 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CLIP2Q9UDT6 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CLIP2Q9UDT6 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CLIP2Q9UDT6 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CLIP2Q9UDT6 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CLIP2Q9UDT6 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CLIP2Q9UDT6 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CLIP2Q9UDT6 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CLIP2Q9UDT6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms