Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBQ6

EXTL2, Exostosin-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXTL2Q9UBQ6 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EXTL2Q9UBQ6 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EXTL2Q9UBQ6 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EXTL2Q9UBQ6 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EXTL2Q9UBQ6 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EXTL2Q9UBQ6 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EXTL2Q9UBQ6 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EXTL2Q9UBQ6 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EXTL2Q9UBQ6 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EXTL2Q9UBQ6 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EXTL2Q9UBQ6 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EXTL2Q9UBQ6 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EXTL2Q9UBQ6 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EXTL2Q9UBQ6 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EXTL2Q9UBQ6 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EXTL2Q9UBQ6 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EXTL2Q9UBQ6 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
EXTL2Q9UBQ6 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EXTL2Q9UBQ6 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
EXTL2Q9UBQ6 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
EXTL2Q9UBQ6 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22■■□□□ 1.11
EXTL2Q9UBQ6 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
EXTL2Q9UBQ6 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EXTL2Q9UBQ6 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EXTL2Q9UBQ6 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
EXTL2Q9UBQ6 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EXTL2Q9UBQ6 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EXTL2Q9UBQ6 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EXTL2Q9UBQ6 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EXTL2Q9UBQ6 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EXTL2Q9UBQ6 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EXTL2Q9UBQ6 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EXTL2Q9UBQ6 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EXTL2Q9UBQ6 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EXTL2Q9UBQ6 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EXTL2Q9UBQ6 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EXTL2Q9UBQ6 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EXTL2Q9UBQ6 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EXTL2Q9UBQ6 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EXTL2Q9UBQ6 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EXTL2Q9UBQ6 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EXTL2Q9UBQ6 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EXTL2Q9UBQ6 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EXTL2Q9UBQ6 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EXTL2Q9UBQ6 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EXTL2Q9UBQ6 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EXTL2Q9UBQ6 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EXTL2Q9UBQ6 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EXTL2Q9UBQ6 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EXTL2Q9UBQ6 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
EXTL2Q9UBQ6 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
EXTL2Q9UBQ6 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
EXTL2Q9UBQ6 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
EXTL2Q9UBQ6 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
EXTL2Q9UBQ6 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
EXTL2Q9UBQ6 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EXTL2Q9UBQ6 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EXTL2Q9UBQ6 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EXTL2Q9UBQ6 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EXTL2Q9UBQ6 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
EXTL2Q9UBQ6 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EXTL2Q9UBQ6 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EXTL2Q9UBQ6 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
EXTL2Q9UBQ6 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EXTL2Q9UBQ6 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EXTL2Q9UBQ6 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EXTL2Q9UBQ6 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EXTL2Q9UBQ6 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EXTL2Q9UBQ6 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EXTL2Q9UBQ6 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EXTL2Q9UBQ6 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EXTL2Q9UBQ6 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EXTL2Q9UBQ6 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EXTL2Q9UBQ6 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EXTL2Q9UBQ6 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EXTL2Q9UBQ6 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EXTL2Q9UBQ6 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
EXTL2Q9UBQ6 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
EXTL2Q9UBQ6 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
EXTL2Q9UBQ6 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
EXTL2Q9UBQ6 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
EXTL2Q9UBQ6 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EXTL2Q9UBQ6 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
EXTL2Q9UBQ6 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EXTL2Q9UBQ6 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EXTL2Q9UBQ6 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EXTL2Q9UBQ6 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EXTL2Q9UBQ6 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EXTL2Q9UBQ6 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EXTL2Q9UBQ6 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EXTL2Q9UBQ6 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EXTL2Q9UBQ6 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EXTL2Q9UBQ6 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EXTL2Q9UBQ6 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EXTL2Q9UBQ6 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EXTL2Q9UBQ6 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EXTL2Q9UBQ6 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EXTL2Q9UBQ6 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EXTL2Q9UBQ6 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
EXTL2Q9UBQ6 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms