Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBI1

COMMD3, COMM domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 195 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD3Q9UBI1 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
COMMD3Q9UBI1 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
COMMD3Q9UBI1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
COMMD3Q9UBI1 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
COMMD3Q9UBI1 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COMMD3Q9UBI1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COMMD3Q9UBI1 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
COMMD3Q9UBI1 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
COMMD3Q9UBI1 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
COMMD3Q9UBI1 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COMMD3Q9UBI1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COMMD3Q9UBI1 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COMMD3Q9UBI1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COMMD3Q9UBI1 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COMMD3Q9UBI1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COMMD3Q9UBI1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COMMD3Q9UBI1 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COMMD3Q9UBI1 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COMMD3Q9UBI1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COMMD3Q9UBI1 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
COMMD3Q9UBI1 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
COMMD3Q9UBI1 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COMMD3Q9UBI1 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
COMMD3Q9UBI1 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COMMD3Q9UBI1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COMMD3Q9UBI1 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COMMD3Q9UBI1 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COMMD3Q9UBI1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COMMD3Q9UBI1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COMMD3Q9UBI1 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COMMD3Q9UBI1 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COMMD3Q9UBI1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COMMD3Q9UBI1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COMMD3Q9UBI1 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COMMD3Q9UBI1 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COMMD3Q9UBI1 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COMMD3Q9UBI1 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COMMD3Q9UBI1 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COMMD3Q9UBI1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COMMD3Q9UBI1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COMMD3Q9UBI1 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
COMMD3Q9UBI1 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
COMMD3Q9UBI1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COMMD3Q9UBI1 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COMMD3Q9UBI1 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COMMD3Q9UBI1 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COMMD3Q9UBI1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COMMD3Q9UBI1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COMMD3Q9UBI1 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COMMD3Q9UBI1 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
COMMD3Q9UBI1 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COMMD3Q9UBI1 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COMMD3Q9UBI1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COMMD3Q9UBI1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COMMD3Q9UBI1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COMMD3Q9UBI1 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COMMD3Q9UBI1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COMMD3Q9UBI1 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COMMD3Q9UBI1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COMMD3Q9UBI1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COMMD3Q9UBI1 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COMMD3Q9UBI1 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COMMD3Q9UBI1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COMMD3Q9UBI1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COMMD3Q9UBI1 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COMMD3Q9UBI1 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COMMD3Q9UBI1 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COMMD3Q9UBI1 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COMMD3Q9UBI1 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COMMD3Q9UBI1 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COMMD3Q9UBI1 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COMMD3Q9UBI1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COMMD3Q9UBI1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COMMD3Q9UBI1 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COMMD3Q9UBI1 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
COMMD3Q9UBI1 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
COMMD3Q9UBI1 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
COMMD3Q9UBI1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
COMMD3Q9UBI1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COMMD3Q9UBI1 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
COMMD3Q9UBI1 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COMMD3Q9UBI1 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
COMMD3Q9UBI1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COMMD3Q9UBI1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
COMMD3Q9UBI1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COMMD3Q9UBI1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COMMD3Q9UBI1 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
COMMD3Q9UBI1 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COMMD3Q9UBI1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
COMMD3Q9UBI1 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COMMD3Q9UBI1 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
COMMD3Q9UBI1 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
COMMD3Q9UBI1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COMMD3Q9UBI1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COMMD3Q9UBI1 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COMMD3Q9UBI1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COMMD3Q9UBI1 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COMMD3Q9UBI1 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COMMD3Q9UBI1 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COMMD3Q9UBI1 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
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