Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2B2

PTGFRN, Prostaglandin F2 receptor negative regulator, humanhuman

Predictions only

Length 879 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGFRNQ9P2B2 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTGFRNQ9P2B2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTGFRNQ9P2B2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTGFRNQ9P2B2 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTGFRNQ9P2B2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTGFRNQ9P2B2 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTGFRNQ9P2B2 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTGFRNQ9P2B2 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTGFRNQ9P2B2 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PTGFRNQ9P2B2 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PTGFRNQ9P2B2 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTGFRNQ9P2B2 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTGFRNQ9P2B2 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTGFRNQ9P2B2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PTGFRNQ9P2B2 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTGFRNQ9P2B2 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTGFRNQ9P2B2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTGFRNQ9P2B2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTGFRNQ9P2B2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTGFRNQ9P2B2 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTGFRNQ9P2B2 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTGFRNQ9P2B2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTGFRNQ9P2B2 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTGFRNQ9P2B2 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTGFRNQ9P2B2 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTGFRNQ9P2B2 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTGFRNQ9P2B2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTGFRNQ9P2B2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTGFRNQ9P2B2 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTGFRNQ9P2B2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTGFRNQ9P2B2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PTGFRNQ9P2B2 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTGFRNQ9P2B2 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTGFRNQ9P2B2 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTGFRNQ9P2B2 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTGFRNQ9P2B2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTGFRNQ9P2B2 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTGFRNQ9P2B2 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTGFRNQ9P2B2 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PTGFRNQ9P2B2 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTGFRNQ9P2B2 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTGFRNQ9P2B2 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTGFRNQ9P2B2 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PTGFRNQ9P2B2 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PTGFRNQ9P2B2 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTGFRNQ9P2B2 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTGFRNQ9P2B2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTGFRNQ9P2B2 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTGFRNQ9P2B2 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTGFRNQ9P2B2 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTGFRNQ9P2B2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTGFRNQ9P2B2 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTGFRNQ9P2B2 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTGFRNQ9P2B2 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTGFRNQ9P2B2 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTGFRNQ9P2B2 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTGFRNQ9P2B2 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTGFRNQ9P2B2 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTGFRNQ9P2B2 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTGFRNQ9P2B2 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTGFRNQ9P2B2 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTGFRNQ9P2B2 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTGFRNQ9P2B2 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTGFRNQ9P2B2 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTGFRNQ9P2B2 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTGFRNQ9P2B2 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTGFRNQ9P2B2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTGFRNQ9P2B2 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PTGFRNQ9P2B2 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PTGFRNQ9P2B2 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTGFRNQ9P2B2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTGFRNQ9P2B2 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTGFRNQ9P2B2 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTGFRNQ9P2B2 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PTGFRNQ9P2B2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTGFRNQ9P2B2 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTGFRNQ9P2B2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTGFRNQ9P2B2 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTGFRNQ9P2B2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTGFRNQ9P2B2 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PTGFRNQ9P2B2 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTGFRNQ9P2B2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTGFRNQ9P2B2 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTGFRNQ9P2B2 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTGFRNQ9P2B2 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTGFRNQ9P2B2 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTGFRNQ9P2B2 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTGFRNQ9P2B2 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTGFRNQ9P2B2 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTGFRNQ9P2B2 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTGFRNQ9P2B2 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PTGFRNQ9P2B2 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTGFRNQ9P2B2 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTGFRNQ9P2B2 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTGFRNQ9P2B2 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTGFRNQ9P2B2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTGFRNQ9P2B2 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PTGFRNQ9P2B2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTGFRNQ9P2B2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTGFRNQ9P2B2 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms