Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z2

CALCOCO1, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO1Q9P1Z2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CALCOCO1Q9P1Z2 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CALCOCO1Q9P1Z2 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CALCOCO1Q9P1Z2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CALCOCO1Q9P1Z2 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CALCOCO1Q9P1Z2 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CALCOCO1Q9P1Z2 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CALCOCO1Q9P1Z2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CALCOCO1Q9P1Z2 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CALCOCO1Q9P1Z2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CALCOCO1Q9P1Z2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CALCOCO1Q9P1Z2 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CALCOCO1Q9P1Z2 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
CALCOCO1Q9P1Z2 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CALCOCO1Q9P1Z2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CALCOCO1Q9P1Z2 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CALCOCO1Q9P1Z2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CALCOCO1Q9P1Z2 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CALCOCO1Q9P1Z2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CALCOCO1Q9P1Z2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CALCOCO1Q9P1Z2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CALCOCO1Q9P1Z2 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CALCOCO1Q9P1Z2 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CALCOCO1Q9P1Z2 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CALCOCO1Q9P1Z2 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CALCOCO1Q9P1Z2 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CALCOCO1Q9P1Z2 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CALCOCO1Q9P1Z2 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CALCOCO1Q9P1Z2 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CALCOCO1Q9P1Z2 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CALCOCO1Q9P1Z2 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CALCOCO1Q9P1Z2 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CALCOCO1Q9P1Z2 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
CALCOCO1Q9P1Z2 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CALCOCO1Q9P1Z2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CALCOCO1Q9P1Z2 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CALCOCO1Q9P1Z2 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CALCOCO1Q9P1Z2 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CALCOCO1Q9P1Z2 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
CALCOCO1Q9P1Z2 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CALCOCO1Q9P1Z2 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CALCOCO1Q9P1Z2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CALCOCO1Q9P1Z2 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CALCOCO1Q9P1Z2 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CALCOCO1Q9P1Z2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CALCOCO1Q9P1Z2 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CALCOCO1Q9P1Z2 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CALCOCO1Q9P1Z2 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CALCOCO1Q9P1Z2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CALCOCO1Q9P1Z2 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CALCOCO1Q9P1Z2 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CALCOCO1Q9P1Z2 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CALCOCO1Q9P1Z2 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CALCOCO1Q9P1Z2 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CALCOCO1Q9P1Z2 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CALCOCO1Q9P1Z2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CALCOCO1Q9P1Z2 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CALCOCO1Q9P1Z2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CALCOCO1Q9P1Z2 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CALCOCO1Q9P1Z2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CALCOCO1Q9P1Z2 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CALCOCO1Q9P1Z2 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CALCOCO1Q9P1Z2 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CALCOCO1Q9P1Z2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CALCOCO1Q9P1Z2 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CALCOCO1Q9P1Z2 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CALCOCO1Q9P1Z2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CALCOCO1Q9P1Z2 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CALCOCO1Q9P1Z2 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CALCOCO1Q9P1Z2 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CALCOCO1Q9P1Z2 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CALCOCO1Q9P1Z2 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CALCOCO1Q9P1Z2 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CALCOCO1Q9P1Z2 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CALCOCO1Q9P1Z2 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CALCOCO1Q9P1Z2 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CALCOCO1Q9P1Z2 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CALCOCO1Q9P1Z2 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CALCOCO1Q9P1Z2 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CALCOCO1Q9P1Z2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CALCOCO1Q9P1Z2 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CALCOCO1Q9P1Z2 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CALCOCO1Q9P1Z2 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CALCOCO1Q9P1Z2 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CALCOCO1Q9P1Z2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CALCOCO1Q9P1Z2 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CALCOCO1Q9P1Z2 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CALCOCO1Q9P1Z2 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CALCOCO1Q9P1Z2 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CALCOCO1Q9P1Z2 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CALCOCO1Q9P1Z2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CALCOCO1Q9P1Z2 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CALCOCO1Q9P1Z2 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CALCOCO1Q9P1Z2 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CALCOCO1Q9P1Z2 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms