Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J7

KCMF1, E3 ubiquitin-protein ligase KCMF1, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCMF1Q9P0J7 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KCMF1Q9P0J7 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KCMF1Q9P0J7 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KCMF1Q9P0J7 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KCMF1Q9P0J7 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
KCMF1Q9P0J7 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KCMF1Q9P0J7 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KCMF1Q9P0J7 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KCMF1Q9P0J7 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KCMF1Q9P0J7 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KCMF1Q9P0J7 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
KCMF1Q9P0J7 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
KCMF1Q9P0J7 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
KCMF1Q9P0J7 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
KCMF1Q9P0J7 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
KCMF1Q9P0J7 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
KCMF1Q9P0J7 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
KCMF1Q9P0J7 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
KCMF1Q9P0J7 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
KCMF1Q9P0J7 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KCMF1Q9P0J7 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KCMF1Q9P0J7 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KCMF1Q9P0J7 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KCMF1Q9P0J7 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KCMF1Q9P0J7 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KCMF1Q9P0J7 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
KCMF1Q9P0J7 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
KCMF1Q9P0J7 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KCMF1Q9P0J7 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KCMF1Q9P0J7 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KCMF1Q9P0J7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KCMF1Q9P0J7 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KCMF1Q9P0J7 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KCMF1Q9P0J7 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KCMF1Q9P0J7 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KCMF1Q9P0J7 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KCMF1Q9P0J7 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KCMF1Q9P0J7 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KCMF1Q9P0J7 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KCMF1Q9P0J7 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KCMF1Q9P0J7 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KCMF1Q9P0J7 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KCMF1Q9P0J7 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KCMF1Q9P0J7 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
KCMF1Q9P0J7 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KCMF1Q9P0J7 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KCMF1Q9P0J7 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KCMF1Q9P0J7 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KCMF1Q9P0J7 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
KCMF1Q9P0J7 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KCMF1Q9P0J7 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KCMF1Q9P0J7 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KCMF1Q9P0J7 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KCMF1Q9P0J7 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KCMF1Q9P0J7 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KCMF1Q9P0J7 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KCMF1Q9P0J7 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
KCMF1Q9P0J7 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KCMF1Q9P0J7 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KCMF1Q9P0J7 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KCMF1Q9P0J7 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KCMF1Q9P0J7 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KCMF1Q9P0J7 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KCMF1Q9P0J7 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
KCMF1Q9P0J7 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KCMF1Q9P0J7 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KCMF1Q9P0J7 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KCMF1Q9P0J7 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KCMF1Q9P0J7 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
KCMF1Q9P0J7 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KCMF1Q9P0J7 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KCMF1Q9P0J7 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KCMF1Q9P0J7 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KCMF1Q9P0J7 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
KCMF1Q9P0J7 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
KCMF1Q9P0J7 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KCMF1Q9P0J7 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KCMF1Q9P0J7 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KCMF1Q9P0J7 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KCMF1Q9P0J7 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KCMF1Q9P0J7 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KCMF1Q9P0J7 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KCMF1Q9P0J7 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KCMF1Q9P0J7 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KCMF1Q9P0J7 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KCMF1Q9P0J7 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KCMF1Q9P0J7 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KCMF1Q9P0J7 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KCMF1Q9P0J7 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KCMF1Q9P0J7 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KCMF1Q9P0J7 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KCMF1Q9P0J7 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KCMF1Q9P0J7 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KCMF1Q9P0J7 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KCMF1Q9P0J7 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KCMF1Q9P0J7 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
KCMF1Q9P0J7 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
KCMF1Q9P0J7 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KCMF1Q9P0J7 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KCMF1Q9P0J7 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms