Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
EHD3Q9NZN3 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
EHD3Q9NZN3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EHD3Q9NZN3 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
EHD3Q9NZN3 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EHD3Q9NZN3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
EHD3Q9NZN3 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EHD3Q9NZN3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EHD3Q9NZN3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EHD3Q9NZN3 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EHD3Q9NZN3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EHD3Q9NZN3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EHD3Q9NZN3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EHD3Q9NZN3 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EHD3Q9NZN3 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EHD3Q9NZN3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EHD3Q9NZN3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EHD3Q9NZN3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EHD3Q9NZN3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EHD3Q9NZN3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EHD3Q9NZN3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EHD3Q9NZN3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EHD3Q9NZN3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EHD3Q9NZN3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EHD3Q9NZN3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
EHD3Q9NZN3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
EHD3Q9NZN3 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EHD3Q9NZN3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EHD3Q9NZN3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
EHD3Q9NZN3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EHD3Q9NZN3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
EHD3Q9NZN3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EHD3Q9NZN3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EHD3Q9NZN3 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EHD3Q9NZN3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EHD3Q9NZN3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
EHD3Q9NZN3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EHD3Q9NZN3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
EHD3Q9NZN3 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
EHD3Q9NZN3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EHD3Q9NZN3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EHD3Q9NZN3 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EHD3Q9NZN3 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EHD3Q9NZN3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EHD3Q9NZN3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EHD3Q9NZN3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EHD3Q9NZN3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EHD3Q9NZN3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EHD3Q9NZN3 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
EHD3Q9NZN3 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
EHD3Q9NZN3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
EHD3Q9NZN3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EHD3Q9NZN3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EHD3Q9NZN3 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EHD3Q9NZN3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EHD3Q9NZN3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EHD3Q9NZN3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EHD3Q9NZN3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
EHD3Q9NZN3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EHD3Q9NZN3 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EHD3Q9NZN3 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EHD3Q9NZN3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EHD3Q9NZN3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EHD3Q9NZN3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EHD3Q9NZN3 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EHD3Q9NZN3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EHD3Q9NZN3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EHD3Q9NZN3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EHD3Q9NZN3 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EHD3Q9NZN3 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EHD3Q9NZN3 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EHD3Q9NZN3 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EHD3Q9NZN3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EHD3Q9NZN3 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EHD3Q9NZN3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EHD3Q9NZN3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
EHD3Q9NZN3 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EHD3Q9NZN3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EHD3Q9NZN3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EHD3Q9NZN3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EHD3Q9NZN3 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EHD3Q9NZN3 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EHD3Q9NZN3 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EHD3Q9NZN3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EHD3Q9NZN3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EHD3Q9NZN3 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EHD3Q9NZN3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
EHD3Q9NZN3 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
EHD3Q9NZN3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
EHD3Q9NZN3 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
EHD3Q9NZN3 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EHD3Q9NZN3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EHD3Q9NZN3 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EHD3Q9NZN3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EHD3Q9NZN3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EHD3Q9NZN3 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EHD3Q9NZN3 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EHD3Q9NZN3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EHD3Q9NZN3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EHD3Q9NZN3 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms