Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ42

PSENEN, Gamma-secretase subunit PEN-2, humanhuman

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSENENQ9NZ42 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSENENQ9NZ42 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSENENQ9NZ42 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSENENQ9NZ42 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSENENQ9NZ42 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSENENQ9NZ42 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSENENQ9NZ42 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSENENQ9NZ42 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSENENQ9NZ42 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PSENENQ9NZ42 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSENENQ9NZ42 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSENENQ9NZ42 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSENENQ9NZ42 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSENENQ9NZ42 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSENENQ9NZ42 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSENENQ9NZ42 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSENENQ9NZ42 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSENENQ9NZ42 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSENENQ9NZ42 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSENENQ9NZ42 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSENENQ9NZ42 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSENENQ9NZ42 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSENENQ9NZ42 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSENENQ9NZ42 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSENENQ9NZ42 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSENENQ9NZ42 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PSENENQ9NZ42 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PSENENQ9NZ42 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PSENENQ9NZ42 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PSENENQ9NZ42 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PSENENQ9NZ42 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PSENENQ9NZ42 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PSENENQ9NZ42 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PSENENQ9NZ42 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PSENENQ9NZ42 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PSENENQ9NZ42 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PSENENQ9NZ42 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PSENENQ9NZ42 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PSENENQ9NZ42 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PSENENQ9NZ42 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PSENENQ9NZ42 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSENENQ9NZ42 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSENENQ9NZ42 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PSENENQ9NZ42 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSENENQ9NZ42 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSENENQ9NZ42 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSENENQ9NZ42 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSENENQ9NZ42 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSENENQ9NZ42 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSENENQ9NZ42 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSENENQ9NZ42 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSENENQ9NZ42 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSENENQ9NZ42 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSENENQ9NZ42 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSENENQ9NZ42 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSENENQ9NZ42 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSENENQ9NZ42 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PSENENQ9NZ42 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PSENENQ9NZ42 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PSENENQ9NZ42 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PSENENQ9NZ42 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PSENENQ9NZ42 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PSENENQ9NZ42 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PSENENQ9NZ42 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PSENENQ9NZ42 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PSENENQ9NZ42 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PSENENQ9NZ42 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PSENENQ9NZ42 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PSENENQ9NZ42 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PSENENQ9NZ42 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PSENENQ9NZ42 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PSENENQ9NZ42 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PSENENQ9NZ42 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PSENENQ9NZ42 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PSENENQ9NZ42 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PSENENQ9NZ42 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PSENENQ9NZ42 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PSENENQ9NZ42 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PSENENQ9NZ42 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PSENENQ9NZ42 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PSENENQ9NZ42 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSENENQ9NZ42 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSENENQ9NZ42 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSENENQ9NZ42 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSENENQ9NZ42 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSENENQ9NZ42 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSENENQ9NZ42 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSENENQ9NZ42 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSENENQ9NZ42 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSENENQ9NZ42 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSENENQ9NZ42 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSENENQ9NZ42 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSENENQ9NZ42 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PSENENQ9NZ42 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PSENENQ9NZ42 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PSENENQ9NZ42 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PSENENQ9NZ42 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PSENENQ9NZ42 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PSENENQ9NZ42 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PSENENQ9NZ42 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms