Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYZ1

TVP23B, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23BQ9NYZ1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TVP23BQ9NYZ1 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TVP23BQ9NYZ1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TVP23BQ9NYZ1 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TVP23BQ9NYZ1 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TVP23BQ9NYZ1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TVP23BQ9NYZ1 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TVP23BQ9NYZ1 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TVP23BQ9NYZ1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TVP23BQ9NYZ1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TVP23BQ9NYZ1 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TVP23BQ9NYZ1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TVP23BQ9NYZ1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TVP23BQ9NYZ1 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TVP23BQ9NYZ1 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TVP23BQ9NYZ1 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TVP23BQ9NYZ1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TVP23BQ9NYZ1 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TVP23BQ9NYZ1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TVP23BQ9NYZ1 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TVP23BQ9NYZ1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TVP23BQ9NYZ1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TVP23BQ9NYZ1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TVP23BQ9NYZ1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TVP23BQ9NYZ1 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TVP23BQ9NYZ1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TVP23BQ9NYZ1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TVP23BQ9NYZ1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TVP23BQ9NYZ1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TVP23BQ9NYZ1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TVP23BQ9NYZ1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TVP23BQ9NYZ1 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TVP23BQ9NYZ1 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TVP23BQ9NYZ1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TVP23BQ9NYZ1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TVP23BQ9NYZ1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TVP23BQ9NYZ1 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TVP23BQ9NYZ1 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TVP23BQ9NYZ1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TVP23BQ9NYZ1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TVP23BQ9NYZ1 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TVP23BQ9NYZ1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TVP23BQ9NYZ1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TVP23BQ9NYZ1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TVP23BQ9NYZ1 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TVP23BQ9NYZ1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TVP23BQ9NYZ1 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TVP23BQ9NYZ1 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TVP23BQ9NYZ1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TVP23BQ9NYZ1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TVP23BQ9NYZ1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TVP23BQ9NYZ1 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TVP23BQ9NYZ1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TVP23BQ9NYZ1 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TVP23BQ9NYZ1 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TVP23BQ9NYZ1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TVP23BQ9NYZ1 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TVP23BQ9NYZ1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TVP23BQ9NYZ1 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TVP23BQ9NYZ1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TVP23BQ9NYZ1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TVP23BQ9NYZ1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TVP23BQ9NYZ1 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TVP23BQ9NYZ1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TVP23BQ9NYZ1 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TVP23BQ9NYZ1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TVP23BQ9NYZ1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TVP23BQ9NYZ1 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TVP23BQ9NYZ1 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TVP23BQ9NYZ1 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TVP23BQ9NYZ1 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TVP23BQ9NYZ1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TVP23BQ9NYZ1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TVP23BQ9NYZ1 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TVP23BQ9NYZ1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TVP23BQ9NYZ1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TVP23BQ9NYZ1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TVP23BQ9NYZ1 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TVP23BQ9NYZ1 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TVP23BQ9NYZ1 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TVP23BQ9NYZ1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TVP23BQ9NYZ1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TVP23BQ9NYZ1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TVP23BQ9NYZ1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TVP23BQ9NYZ1 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TVP23BQ9NYZ1 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TVP23BQ9NYZ1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TVP23BQ9NYZ1 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TVP23BQ9NYZ1 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TVP23BQ9NYZ1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TVP23BQ9NYZ1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TVP23BQ9NYZ1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TVP23BQ9NYZ1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TVP23BQ9NYZ1 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TVP23BQ9NYZ1 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TVP23BQ9NYZ1 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TVP23BQ9NYZ1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TVP23BQ9NYZ1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TVP23BQ9NYZ1 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TVP23BQ9NYZ1 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms