Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYK1

TLR7, Toll-like receptor 7, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,049 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR7Q9NYK1 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC31.35■■■□□ 2.61
TLR7Q9NYK1 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
TLR7Q9NYK1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
TLR7Q9NYK1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
TLR7Q9NYK1 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
TLR7Q9NYK1 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC31.34■■■□□ 2.61
TLR7Q9NYK1 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC31.34■■■□□ 2.61
TLR7Q9NYK1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
TLR7Q9NYK1 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC31.32■■■□□ 2.6
TLR7Q9NYK1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC31.32■■■□□ 2.6
TLR7Q9NYK1 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
TLR7Q9NYK1 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
TLR7Q9NYK1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
TLR7Q9NYK1 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
TLR7Q9NYK1 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
TLR7Q9NYK1 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
TLR7Q9NYK1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
TLR7Q9NYK1 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
TLR7Q9NYK1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
TLR7Q9NYK1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
TLR7Q9NYK1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
TLR7Q9NYK1 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
TLR7Q9NYK1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
TLR7Q9NYK1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
TLR7Q9NYK1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC31.27■■■□□ 2.6
TLR7Q9NYK1 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
TLR7Q9NYK1 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
TLR7Q9NYK1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
TLR7Q9NYK1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
TLR7Q9NYK1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
TLR7Q9NYK1 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
TLR7Q9NYK1 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
TLR7Q9NYK1 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
TLR7Q9NYK1 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
TLR7Q9NYK1 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
TLR7Q9NYK1 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
TLR7Q9NYK1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
TLR7Q9NYK1 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
TLR7Q9NYK1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC31.2■■■□□ 2.59
TLR7Q9NYK1 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
TLR7Q9NYK1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
TLR7Q9NYK1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.58
TLR7Q9NYK1 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
TLR7Q9NYK1 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
TLR7Q9NYK1 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
TLR7Q9NYK1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
TLR7Q9NYK1 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
TLR7Q9NYK1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
TLR7Q9NYK1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
TLR7Q9NYK1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
TLR7Q9NYK1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.57
TLR7Q9NYK1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
TLR7Q9NYK1 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
TLR7Q9NYK1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
TLR7Q9NYK1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
TLR7Q9NYK1 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
TLR7Q9NYK1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
TLR7Q9NYK1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
TLR7Q9NYK1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
TLR7Q9NYK1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
TLR7Q9NYK1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
TLR7Q9NYK1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
TLR7Q9NYK1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
TLR7Q9NYK1 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
TLR7Q9NYK1 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
TLR7Q9NYK1 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
TLR7Q9NYK1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
TLR7Q9NYK1 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
TLR7Q9NYK1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
TLR7Q9NYK1 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
TLR7Q9NYK1 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
TLR7Q9NYK1 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
TLR7Q9NYK1 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
TLR7Q9NYK1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
TLR7Q9NYK1 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
TLR7Q9NYK1 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
TLR7Q9NYK1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
TLR7Q9NYK1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
TLR7Q9NYK1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
TLR7Q9NYK1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
TLR7Q9NYK1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
TLR7Q9NYK1 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
TLR7Q9NYK1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
TLR7Q9NYK1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
TLR7Q9NYK1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
TLR7Q9NYK1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
TLR7Q9NYK1 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.03■■■□□ 2.56
TLR7Q9NYK1 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
TLR7Q9NYK1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
TLR7Q9NYK1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
TLR7Q9NYK1 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
TLR7Q9NYK1 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
TLR7Q9NYK1 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
TLR7Q9NYK1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
TLR7Q9NYK1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC31.01■■■□□ 2.56
TLR7Q9NYK1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
TLR7Q9NYK1 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
TLR7Q9NYK1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
TLR7Q9NYK1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
TLR7Q9NYK1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms