Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUQ9

FAM49B, Protein FAM49B, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM49BQ9NUQ9 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
FAM49BQ9NUQ9 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
FAM49BQ9NUQ9 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
FAM49BQ9NUQ9 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
FAM49BQ9NUQ9 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
FAM49BQ9NUQ9 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
FAM49BQ9NUQ9 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
FAM49BQ9NUQ9 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
FAM49BQ9NUQ9 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
FAM49BQ9NUQ9 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
FAM49BQ9NUQ9 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
FAM49BQ9NUQ9 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
FAM49BQ9NUQ9 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
FAM49BQ9NUQ9 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
FAM49BQ9NUQ9 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
FAM49BQ9NUQ9 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
FAM49BQ9NUQ9 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
FAM49BQ9NUQ9 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FAM49BQ9NUQ9 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FAM49BQ9NUQ9 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FAM49BQ9NUQ9 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FAM49BQ9NUQ9 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FAM49BQ9NUQ9 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FAM49BQ9NUQ9 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
FAM49BQ9NUQ9 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FAM49BQ9NUQ9 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
FAM49BQ9NUQ9 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
FAM49BQ9NUQ9 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
FAM49BQ9NUQ9 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
FAM49BQ9NUQ9 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FAM49BQ9NUQ9 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FAM49BQ9NUQ9 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
FAM49BQ9NUQ9 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
FAM49BQ9NUQ9 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
FAM49BQ9NUQ9 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
FAM49BQ9NUQ9 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
FAM49BQ9NUQ9 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
FAM49BQ9NUQ9 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
FAM49BQ9NUQ9 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FAM49BQ9NUQ9 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27■■□□□ 1.91
FAM49BQ9NUQ9 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
FAM49BQ9NUQ9 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
FAM49BQ9NUQ9 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FAM49BQ9NUQ9 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FAM49BQ9NUQ9 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FAM49BQ9NUQ9 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
FAM49BQ9NUQ9 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
FAM49BQ9NUQ9 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
FAM49BQ9NUQ9 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
FAM49BQ9NUQ9 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FAM49BQ9NUQ9 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FAM49BQ9NUQ9 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FAM49BQ9NUQ9 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
FAM49BQ9NUQ9 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
FAM49BQ9NUQ9 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
FAM49BQ9NUQ9 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
FAM49BQ9NUQ9 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
FAM49BQ9NUQ9 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
FAM49BQ9NUQ9 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
FAM49BQ9NUQ9 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
FAM49BQ9NUQ9 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
FAM49BQ9NUQ9 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
FAM49BQ9NUQ9 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
FAM49BQ9NUQ9 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
FAM49BQ9NUQ9 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
FAM49BQ9NUQ9 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
FAM49BQ9NUQ9 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
FAM49BQ9NUQ9 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
FAM49BQ9NUQ9 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
FAM49BQ9NUQ9 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
FAM49BQ9NUQ9 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
FAM49BQ9NUQ9 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
FAM49BQ9NUQ9 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
FAM49BQ9NUQ9 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
FAM49BQ9NUQ9 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
FAM49BQ9NUQ9 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
FAM49BQ9NUQ9 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
FAM49BQ9NUQ9 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
FAM49BQ9NUQ9 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
FAM49BQ9NUQ9 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
FAM49BQ9NUQ9 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
FAM49BQ9NUQ9 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
FAM49BQ9NUQ9 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
FAM49BQ9NUQ9 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
FAM49BQ9NUQ9 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
FAM49BQ9NUQ9 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
FAM49BQ9NUQ9 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
FAM49BQ9NUQ9 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
FAM49BQ9NUQ9 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
FAM49BQ9NUQ9 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
FAM49BQ9NUQ9 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
FAM49BQ9NUQ9 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
FAM49BQ9NUQ9 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
FAM49BQ9NUQ9 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
FAM49BQ9NUQ9 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
FAM49BQ9NUQ9 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
FAM49BQ9NUQ9 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
FAM49BQ9NUQ9 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
FAM49BQ9NUQ9 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
FAM49BQ9NUQ9 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms