Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUQ8

ABCF3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF3Q9NUQ8 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ABCF3Q9NUQ8 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ABCF3Q9NUQ8 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ABCF3Q9NUQ8 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ABCF3Q9NUQ8 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ABCF3Q9NUQ8 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ABCF3Q9NUQ8 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ABCF3Q9NUQ8 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ABCF3Q9NUQ8 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ABCF3Q9NUQ8 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ABCF3Q9NUQ8 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ABCF3Q9NUQ8 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ABCF3Q9NUQ8 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
ABCF3Q9NUQ8 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
ABCF3Q9NUQ8 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ABCF3Q9NUQ8 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ABCF3Q9NUQ8 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ABCF3Q9NUQ8 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ABCF3Q9NUQ8 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ABCF3Q9NUQ8 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ABCF3Q9NUQ8 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ABCF3Q9NUQ8 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
ABCF3Q9NUQ8 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ABCF3Q9NUQ8 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ABCF3Q9NUQ8 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ABCF3Q9NUQ8 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ABCF3Q9NUQ8 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ABCF3Q9NUQ8 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ABCF3Q9NUQ8 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ABCF3Q9NUQ8 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ABCF3Q9NUQ8 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ABCF3Q9NUQ8 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ABCF3Q9NUQ8 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ABCF3Q9NUQ8 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ABCF3Q9NUQ8 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ABCF3Q9NUQ8 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ABCF3Q9NUQ8 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ABCF3Q9NUQ8 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ABCF3Q9NUQ8 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ABCF3Q9NUQ8 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ABCF3Q9NUQ8 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ABCF3Q9NUQ8 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ABCF3Q9NUQ8 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ABCF3Q9NUQ8 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ABCF3Q9NUQ8 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ABCF3Q9NUQ8 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ABCF3Q9NUQ8 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ABCF3Q9NUQ8 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ABCF3Q9NUQ8 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ABCF3Q9NUQ8 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ABCF3Q9NUQ8 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ABCF3Q9NUQ8 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ABCF3Q9NUQ8 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ABCF3Q9NUQ8 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ABCF3Q9NUQ8 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ABCF3Q9NUQ8 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ABCF3Q9NUQ8 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ABCF3Q9NUQ8 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ABCF3Q9NUQ8 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ABCF3Q9NUQ8 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ABCF3Q9NUQ8 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ABCF3Q9NUQ8 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
ABCF3Q9NUQ8 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ABCF3Q9NUQ8 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ABCF3Q9NUQ8 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ABCF3Q9NUQ8 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ABCF3Q9NUQ8 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ABCF3Q9NUQ8 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ABCF3Q9NUQ8 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ABCF3Q9NUQ8 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ABCF3Q9NUQ8 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ABCF3Q9NUQ8 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ABCF3Q9NUQ8 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ABCF3Q9NUQ8 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ABCF3Q9NUQ8 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ABCF3Q9NUQ8 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ABCF3Q9NUQ8 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ABCF3Q9NUQ8 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ABCF3Q9NUQ8 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ABCF3Q9NUQ8 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ABCF3Q9NUQ8 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ABCF3Q9NUQ8 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ABCF3Q9NUQ8 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ABCF3Q9NUQ8 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ABCF3Q9NUQ8 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ABCF3Q9NUQ8 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ABCF3Q9NUQ8 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ABCF3Q9NUQ8 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ABCF3Q9NUQ8 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ABCF3Q9NUQ8 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ABCF3Q9NUQ8 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ABCF3Q9NUQ8 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ABCF3Q9NUQ8 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ABCF3Q9NUQ8 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ABCF3Q9NUQ8 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ABCF3Q9NUQ8 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ABCF3Q9NUQ8 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ABCF3Q9NUQ8 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ABCF3Q9NUQ8 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ABCF3Q9NUQ8 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms