Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTN9

SEMA4G, Semaphorin-4G, humanhuman

Predictions only

Length 838 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4GQ9NTN9 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SEMA4GQ9NTN9 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SEMA4GQ9NTN9 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SEMA4GQ9NTN9 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SEMA4GQ9NTN9 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SEMA4GQ9NTN9 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SEMA4GQ9NTN9 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SEMA4GQ9NTN9 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SEMA4GQ9NTN9 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SEMA4GQ9NTN9 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SEMA4GQ9NTN9 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SEMA4GQ9NTN9 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SEMA4GQ9NTN9 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SEMA4GQ9NTN9 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SEMA4GQ9NTN9 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SEMA4GQ9NTN9 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SEMA4GQ9NTN9 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SEMA4GQ9NTN9 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SEMA4GQ9NTN9 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SEMA4GQ9NTN9 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SEMA4GQ9NTN9 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SEMA4GQ9NTN9 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SEMA4GQ9NTN9 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SEMA4GQ9NTN9 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SEMA4GQ9NTN9 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SEMA4GQ9NTN9 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SEMA4GQ9NTN9 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SEMA4GQ9NTN9 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SEMA4GQ9NTN9 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SEMA4GQ9NTN9 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SEMA4GQ9NTN9 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SEMA4GQ9NTN9 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SEMA4GQ9NTN9 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SEMA4GQ9NTN9 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SEMA4GQ9NTN9 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SEMA4GQ9NTN9 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SEMA4GQ9NTN9 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SEMA4GQ9NTN9 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SEMA4GQ9NTN9 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SEMA4GQ9NTN9 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SEMA4GQ9NTN9 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SEMA4GQ9NTN9 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SEMA4GQ9NTN9 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SEMA4GQ9NTN9 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SEMA4GQ9NTN9 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SEMA4GQ9NTN9 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SEMA4GQ9NTN9 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SEMA4GQ9NTN9 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SEMA4GQ9NTN9 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SEMA4GQ9NTN9 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SEMA4GQ9NTN9 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SEMA4GQ9NTN9 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SEMA4GQ9NTN9 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SEMA4GQ9NTN9 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SEMA4GQ9NTN9 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SEMA4GQ9NTN9 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SEMA4GQ9NTN9 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SEMA4GQ9NTN9 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SEMA4GQ9NTN9 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SEMA4GQ9NTN9 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SEMA4GQ9NTN9 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SEMA4GQ9NTN9 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SEMA4GQ9NTN9 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SEMA4GQ9NTN9 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SEMA4GQ9NTN9 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SEMA4GQ9NTN9 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SEMA4GQ9NTN9 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SEMA4GQ9NTN9 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SEMA4GQ9NTN9 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SEMA4GQ9NTN9 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SEMA4GQ9NTN9 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SEMA4GQ9NTN9 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SEMA4GQ9NTN9 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SEMA4GQ9NTN9 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SEMA4GQ9NTN9 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SEMA4GQ9NTN9 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SEMA4GQ9NTN9 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SEMA4GQ9NTN9 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SEMA4GQ9NTN9 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SEMA4GQ9NTN9 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SEMA4GQ9NTN9 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SEMA4GQ9NTN9 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SEMA4GQ9NTN9 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SEMA4GQ9NTN9 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SEMA4GQ9NTN9 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SEMA4GQ9NTN9 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SEMA4GQ9NTN9 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SEMA4GQ9NTN9 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SEMA4GQ9NTN9 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SEMA4GQ9NTN9 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SEMA4GQ9NTN9 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SEMA4GQ9NTN9 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SEMA4GQ9NTN9 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SEMA4GQ9NTN9 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SEMA4GQ9NTN9 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SEMA4GQ9NTN9 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SEMA4GQ9NTN9 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SEMA4GQ9NTN9 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SEMA4GQ9NTN9 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SEMA4GQ9NTN9 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms