Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSI8

SAMSN1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMSN1Q9NSI8 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SAMSN1Q9NSI8 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SAMSN1Q9NSI8 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SAMSN1Q9NSI8 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SAMSN1Q9NSI8 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
SAMSN1Q9NSI8 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SAMSN1Q9NSI8 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SAMSN1Q9NSI8 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
SAMSN1Q9NSI8 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SAMSN1Q9NSI8 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SAMSN1Q9NSI8 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SAMSN1Q9NSI8 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
SAMSN1Q9NSI8 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SAMSN1Q9NSI8 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
SAMSN1Q9NSI8 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SAMSN1Q9NSI8 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SAMSN1Q9NSI8 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SAMSN1Q9NSI8 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28■■■□□ 2.07
SAMSN1Q9NSI8 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SAMSN1Q9NSI8 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SAMSN1Q9NSI8 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SAMSN1Q9NSI8 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SAMSN1Q9NSI8 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SAMSN1Q9NSI8 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SAMSN1Q9NSI8 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SAMSN1Q9NSI8 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SAMSN1Q9NSI8 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SAMSN1Q9NSI8 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SAMSN1Q9NSI8 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SAMSN1Q9NSI8 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SAMSN1Q9NSI8 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SAMSN1Q9NSI8 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SAMSN1Q9NSI8 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
SAMSN1Q9NSI8 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SAMSN1Q9NSI8 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SAMSN1Q9NSI8 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SAMSN1Q9NSI8 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SAMSN1Q9NSI8 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SAMSN1Q9NSI8 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SAMSN1Q9NSI8 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SAMSN1Q9NSI8 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SAMSN1Q9NSI8 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SAMSN1Q9NSI8 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SAMSN1Q9NSI8 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SAMSN1Q9NSI8 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SAMSN1Q9NSI8 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SAMSN1Q9NSI8 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SAMSN1Q9NSI8 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SAMSN1Q9NSI8 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
SAMSN1Q9NSI8 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SAMSN1Q9NSI8 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SAMSN1Q9NSI8 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
SAMSN1Q9NSI8 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SAMSN1Q9NSI8 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SAMSN1Q9NSI8 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SAMSN1Q9NSI8 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SAMSN1Q9NSI8 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SAMSN1Q9NSI8 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SAMSN1Q9NSI8 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SAMSN1Q9NSI8 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SAMSN1Q9NSI8 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SAMSN1Q9NSI8 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SAMSN1Q9NSI8 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SAMSN1Q9NSI8 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SAMSN1Q9NSI8 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SAMSN1Q9NSI8 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SAMSN1Q9NSI8 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SAMSN1Q9NSI8 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SAMSN1Q9NSI8 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SAMSN1Q9NSI8 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
SAMSN1Q9NSI8 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SAMSN1Q9NSI8 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SAMSN1Q9NSI8 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
SAMSN1Q9NSI8 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SAMSN1Q9NSI8 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SAMSN1Q9NSI8 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SAMSN1Q9NSI8 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
SAMSN1Q9NSI8 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SAMSN1Q9NSI8 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SAMSN1Q9NSI8 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SAMSN1Q9NSI8 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SAMSN1Q9NSI8 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SAMSN1Q9NSI8 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SAMSN1Q9NSI8 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SAMSN1Q9NSI8 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SAMSN1Q9NSI8 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SAMSN1Q9NSI8 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SAMSN1Q9NSI8 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SAMSN1Q9NSI8 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SAMSN1Q9NSI8 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SAMSN1Q9NSI8 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SAMSN1Q9NSI8 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SAMSN1Q9NSI8 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SAMSN1Q9NSI8 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SAMSN1Q9NSI8 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SAMSN1Q9NSI8 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SAMSN1Q9NSI8 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SAMSN1Q9NSI8 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SAMSN1Q9NSI8 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SAMSN1Q9NSI8 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms