Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB2

KRT84, Keratin, type II cuticular Hb4, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT84Q9NSB2 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT84Q9NSB2 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT84Q9NSB2 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT84Q9NSB2 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT84Q9NSB2 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT84Q9NSB2 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT84Q9NSB2 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT84Q9NSB2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT84Q9NSB2 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT84Q9NSB2 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT84Q9NSB2 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT84Q9NSB2 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT84Q9NSB2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT84Q9NSB2 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT84Q9NSB2 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT84Q9NSB2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT84Q9NSB2 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT84Q9NSB2 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT84Q9NSB2 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT84Q9NSB2 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT84Q9NSB2 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT84Q9NSB2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KRT84Q9NSB2 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KRT84Q9NSB2 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KRT84Q9NSB2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
KRT84Q9NSB2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
KRT84Q9NSB2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
KRT84Q9NSB2 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRT84Q9NSB2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRT84Q9NSB2 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRT84Q9NSB2 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRT84Q9NSB2 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRT84Q9NSB2 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT84Q9NSB2 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT84Q9NSB2 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT84Q9NSB2 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT84Q9NSB2 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT84Q9NSB2 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT84Q9NSB2 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT84Q9NSB2 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT84Q9NSB2 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT84Q9NSB2 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT84Q9NSB2 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT84Q9NSB2 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT84Q9NSB2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRT84Q9NSB2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRT84Q9NSB2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRT84Q9NSB2 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRT84Q9NSB2 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRT84Q9NSB2 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRT84Q9NSB2 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT84Q9NSB2 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT84Q9NSB2 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT84Q9NSB2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT84Q9NSB2 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT84Q9NSB2 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT84Q9NSB2 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT84Q9NSB2 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT84Q9NSB2 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT84Q9NSB2 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT84Q9NSB2 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT84Q9NSB2 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT84Q9NSB2 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT84Q9NSB2 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT84Q9NSB2 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT84Q9NSB2 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT84Q9NSB2 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT84Q9NSB2 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT84Q9NSB2 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT84Q9NSB2 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT84Q9NSB2 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT84Q9NSB2 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT84Q9NSB2 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT84Q9NSB2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT84Q9NSB2 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT84Q9NSB2 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT84Q9NSB2 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT84Q9NSB2 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT84Q9NSB2 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT84Q9NSB2 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT84Q9NSB2 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT84Q9NSB2 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT84Q9NSB2 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT84Q9NSB2 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT84Q9NSB2 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT84Q9NSB2 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT84Q9NSB2 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT84Q9NSB2 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT84Q9NSB2 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT84Q9NSB2 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT84Q9NSB2 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT84Q9NSB2 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT84Q9NSB2 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT84Q9NSB2 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT84Q9NSB2 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT84Q9NSB2 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT84Q9NSB2 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT84Q9NSB2 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT84Q9NSB2 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT84Q9NSB2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 444.4 ms