Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS85

CA10, Carbonic anhydrase-related protein 10, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA10Q9NS85 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CA10Q9NS85 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CA10Q9NS85 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CA10Q9NS85 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CA10Q9NS85 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CA10Q9NS85 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CA10Q9NS85 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CA10Q9NS85 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CA10Q9NS85 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CA10Q9NS85 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CA10Q9NS85 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CA10Q9NS85 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CA10Q9NS85 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CA10Q9NS85 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CA10Q9NS85 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CA10Q9NS85 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CA10Q9NS85 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CA10Q9NS85 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CA10Q9NS85 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CA10Q9NS85 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CA10Q9NS85 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CA10Q9NS85 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CA10Q9NS85 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CA10Q9NS85 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CA10Q9NS85 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CA10Q9NS85 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CA10Q9NS85 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CA10Q9NS85 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CA10Q9NS85 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CA10Q9NS85 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CA10Q9NS85 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CA10Q9NS85 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CA10Q9NS85 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CA10Q9NS85 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CA10Q9NS85 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CA10Q9NS85 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CA10Q9NS85 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CA10Q9NS85 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CA10Q9NS85 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CA10Q9NS85 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CA10Q9NS85 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CA10Q9NS85 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CA10Q9NS85 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CA10Q9NS85 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CA10Q9NS85 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CA10Q9NS85 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CA10Q9NS85 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CA10Q9NS85 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CA10Q9NS85 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CA10Q9NS85 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CA10Q9NS85 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CA10Q9NS85 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CA10Q9NS85 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CA10Q9NS85 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CA10Q9NS85 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CA10Q9NS85 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CA10Q9NS85 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CA10Q9NS85 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CA10Q9NS85 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CA10Q9NS85 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CA10Q9NS85 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CA10Q9NS85 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CA10Q9NS85 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CA10Q9NS85 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CA10Q9NS85 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CA10Q9NS85 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CA10Q9NS85 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CA10Q9NS85 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CA10Q9NS85 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CA10Q9NS85 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CA10Q9NS85 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CA10Q9NS85 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CA10Q9NS85 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CA10Q9NS85 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CA10Q9NS85 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CA10Q9NS85 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CA10Q9NS85 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CA10Q9NS85 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CA10Q9NS85 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CA10Q9NS85 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CA10Q9NS85 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CA10Q9NS85 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CA10Q9NS85 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CA10Q9NS85 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CA10Q9NS85 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CA10Q9NS85 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CA10Q9NS85 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CA10Q9NS85 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CA10Q9NS85 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CA10Q9NS85 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CA10Q9NS85 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CA10Q9NS85 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CA10Q9NS85 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CA10Q9NS85 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CA10Q9NS85 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CA10Q9NS85 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CA10Q9NS85 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CA10Q9NS85 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CA10Q9NS85 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CA10Q9NS85 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.8 ms