Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS61

KCNIP2, Kv channel-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP2Q9NS61 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KCNIP2Q9NS61 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KCNIP2Q9NS61 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KCNIP2Q9NS61 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KCNIP2Q9NS61 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KCNIP2Q9NS61 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KCNIP2Q9NS61 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
KCNIP2Q9NS61 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
KCNIP2Q9NS61 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCNIP2Q9NS61 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCNIP2Q9NS61 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
KCNIP2Q9NS61 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCNIP2Q9NS61 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCNIP2Q9NS61 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCNIP2Q9NS61 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCNIP2Q9NS61 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCNIP2Q9NS61 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCNIP2Q9NS61 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCNIP2Q9NS61 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KCNIP2Q9NS61 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
KCNIP2Q9NS61 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KCNIP2Q9NS61 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KCNIP2Q9NS61 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KCNIP2Q9NS61 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KCNIP2Q9NS61 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KCNIP2Q9NS61 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNIP2Q9NS61 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNIP2Q9NS61 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNIP2Q9NS61 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNIP2Q9NS61 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNIP2Q9NS61 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNIP2Q9NS61 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNIP2Q9NS61 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KCNIP2Q9NS61 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KCNIP2Q9NS61 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KCNIP2Q9NS61 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KCNIP2Q9NS61 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KCNIP2Q9NS61 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KCNIP2Q9NS61 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KCNIP2Q9NS61 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KCNIP2Q9NS61 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KCNIP2Q9NS61 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KCNIP2Q9NS61 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KCNIP2Q9NS61 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KCNIP2Q9NS61 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KCNIP2Q9NS61 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KCNIP2Q9NS61 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KCNIP2Q9NS61 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KCNIP2Q9NS61 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KCNIP2Q9NS61 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KCNIP2Q9NS61 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KCNIP2Q9NS61 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KCNIP2Q9NS61 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KCNIP2Q9NS61 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KCNIP2Q9NS61 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KCNIP2Q9NS61 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KCNIP2Q9NS61 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KCNIP2Q9NS61 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
KCNIP2Q9NS61 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KCNIP2Q9NS61 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KCNIP2Q9NS61 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KCNIP2Q9NS61 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KCNIP2Q9NS61 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KCNIP2Q9NS61 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KCNIP2Q9NS61 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KCNIP2Q9NS61 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KCNIP2Q9NS61 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
KCNIP2Q9NS61 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KCNIP2Q9NS61 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KCNIP2Q9NS61 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KCNIP2Q9NS61 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
KCNIP2Q9NS61 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KCNIP2Q9NS61 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KCNIP2Q9NS61 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KCNIP2Q9NS61 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KCNIP2Q9NS61 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KCNIP2Q9NS61 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
KCNIP2Q9NS61 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
KCNIP2Q9NS61 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KCNIP2Q9NS61 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KCNIP2Q9NS61 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
KCNIP2Q9NS61 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KCNIP2Q9NS61 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
KCNIP2Q9NS61 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
KCNIP2Q9NS61 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
KCNIP2Q9NS61 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
KCNIP2Q9NS61 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KCNIP2Q9NS61 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KCNIP2Q9NS61 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KCNIP2Q9NS61 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
KCNIP2Q9NS61 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
KCNIP2Q9NS61 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KCNIP2Q9NS61 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
KCNIP2Q9NS61 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KCNIP2Q9NS61 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KCNIP2Q9NS61 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KCNIP2Q9NS61 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
KCNIP2Q9NS61 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KCNIP2Q9NS61 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
KCNIP2Q9NS61 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms