Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQZ2

UTP3, Something about silencing protein 10, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP3Q9NQZ2 SLC43A3-204ENST00000524863 539 ntTSL 314.43□□□□□ -0.14e-7■■■■■ 574
UTP3Q9NQZ2 SLC43A3-201ENST00000352187 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.574e-7■■■■■ 574
UTP3Q9NQZ2 SLC43A3-206ENST00000525474 801 ntTSL 510.58□□□□□ -0.724e-7■■■■■ 574
UTP3Q9NQZ2 SLC43A3-215ENST00000529748 397 ntTSL 310.54□□□□□ -0.724e-7■■■■■ 574
UTP3Q9NQZ2 PSMC5-203ENST00000578570 1680 ntTSL 222.85■■□□□ 1.253e-69■■■■■ 571.4
UTP3Q9NQZ2 PSMC5-215ENST00000583283 602 ntTSL 421.21■□□□□ 0.993e-69■■■■■ 571.4
UTP3Q9NQZ2 PSMC5-210ENST00000581764 2107 ntTSL 520.07■□□□□ 0.83e-69■■■■■ 571.4
UTP3Q9NQZ2 PSMC5-213ENST00000582130 828 ntTSL 316.26■□□□□ 0.193e-69■■■■■ 571.4
UTP3Q9NQZ2 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.173e-69■■■■■ 571.4
UTP3Q9NQZ2 PSMC5-205ENST00000579147 2586 ntTSL 215.42■□□□□ 0.063e-69■■■■■ 571.4
UTP3Q9NQZ2 PSMC5-217ENST00000584536 804 ntTSL 515.41■□□□□ 0.063e-69■■■■■ 571.4
UTP3Q9NQZ2 PSMC5-214ENST00000582420 394 ntTSL 415.08■□□□□ 03e-69■■■■■ 571.4
UTP3Q9NQZ2 PSMC5-220ENST00000585123 899 ntTSL 514.7□□□□□ -0.063e-69■■■■■ 571.4
UTP3Q9NQZ2 PSMC5-216ENST00000584320 804 ntTSL 514.59□□□□□ -0.073e-69■■■■■ 571.4
UTP3Q9NQZ2 PSMC5-201ENST00000310144 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.173e-69■■■■■ 571.4
UTP3Q9NQZ2 PSMC5-206ENST00000579708 558 ntTSL 411.39□□□□□ -0.593e-69■■■■■ 571.4
UTP3Q9NQZ2 PSMC5-221ENST00000585242 1178 ntTSL 510.46□□□□□ -0.733e-69■■■■■ 571.4
UTP3Q9NQZ2 PSMC5-211ENST00000581842 809 ntTSL 510.42□□□□□ -0.743e-69■■■■■ 571.4
UTP3Q9NQZ2 NT5DC2-209ENST00000478091 590 ntTSL 319.56■□□□□ 0.723e-10■■■■■ 559.5
UTP3Q9NQZ2 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.463e-23■■■■■ 559
UTP3Q9NQZ2 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.833e-23■■■■■ 559
UTP3Q9NQZ2 GDPD5-213ENST00000532435 825 ntTSL 523.75■■□□□ 1.393e-23■■■■■ 559
UTP3Q9NQZ2 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.5■■□□□ 1.352e-45■■■■■ 559
UTP3Q9NQZ2 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.323e-23■■■■■ 559
UTP3Q9NQZ2 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.243e-23■■■■■ 559
UTP3Q9NQZ2 TRPT1-209ENST00000540472 355 ntTSL 521.9■■□□□ 1.13e-23■■■■■ 559
UTP3Q9NQZ2 UBE2F-212ENST00000439338 873 ntTSL 521.88■■□□□ 1.093e-23■■■■■ 559
UTP3Q9NQZ2 UBE2F-206ENST00000416292 552 ntTSL 221.88■■□□□ 1.093e-23■■■■■ 559
UTP3Q9NQZ2 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.083e-23■■■■■ 559
UTP3Q9NQZ2 KDM5A-210ENST00000544760 2338 ntTSL 221.56■■□□□ 1.043e-23■■■■■ 559
UTP3Q9NQZ2 UBE2F-217ENST00000448502 561 ntTSL 421.44■■□□□ 1.023e-23■■■■■ 559
UTP3Q9NQZ2 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 13e-23■■■■■ 559
UTP3Q9NQZ2 UBE2F-207ENST00000417231 984 ntTSL 521.14■□□□□ 0.973e-23■■■■■ 559
UTP3Q9NQZ2 UBE2F-215ENST00000441728 1242 ntTSL 221.12■□□□□ 0.973e-23■■■■■ 559
UTP3Q9NQZ2 UBE2F-209ENST00000433568 574 ntTSL 421.12■□□□□ 0.973e-23■■■■■ 559
UTP3Q9NQZ2 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.973e-23■■■■■ 559
UTP3Q9NQZ2 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.873e-23■■■■■ 559
UTP3Q9NQZ2 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.843e-23■■■■■ 559
UTP3Q9NQZ2 SLC35C2-207ENST00000480329 919 ntTSL 219.76■□□□□ 0.753e-30■■■■■ 559
UTP3Q9NQZ2 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.643e-23■■■■■ 559
UTP3Q9NQZ2 COX20-205ENST00000498262 2290 ntTSL 218.7■□□□□ 0.583e-23■■■■■ 559
UTP3Q9NQZ2 TRPT1-212ENST00000542040 914 ntTSL 218.44■□□□□ 0.543e-23■■■■■ 559
UTP3Q9NQZ2 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.543e-23■■■■■ 559
UTP3Q9NQZ2 UBE2F-218ENST00000454786 1292 ntTSL 518.15■□□□□ 0.53e-23■■■■■ 559
UTP3Q9NQZ2 VPS26B-206ENST00000531741 2073 ntTSL 218.03■□□□□ 0.483e-23■■■■■ 559
UTP3Q9NQZ2 GDPD5-207ENST00000528031 724 ntTSL 217.54■□□□□ 0.43e-23■■■■■ 559
UTP3Q9NQZ2 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.393e-23■■■■■ 559
UTP3Q9NQZ2 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.343e-23■■■■■ 559
UTP3Q9NQZ2 UBE2F-214ENST00000440223 830 ntTSL 317.14■□□□□ 0.333e-23■■■■■ 559
UTP3Q9NQZ2 STK11IP-206ENST00000465230 771 ntTSL 317.03■□□□□ 0.323e-23■■■■■ 559
UTP3Q9NQZ2 LINC00969-201ENST00000414625 729 ntTSL 516.98■□□□□ 0.313e-23■■■■■ 559
UTP3Q9NQZ2 MRNIP-207ENST00000519208 662 ntTSL 416.54■□□□□ 0.243e-23■■■■■ 559
UTP3Q9NQZ2 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.213e-23■■■■■ 559
UTP3Q9NQZ2 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.193e-23■■■■■ 559
UTP3Q9NQZ2 SLC35C2-212ENST00000493599 2510 ntTSL 216.14■□□□□ 0.173e-30■■■■■ 559
UTP3Q9NQZ2 MRNIP-211ENST00000520150 1054 ntTSL 215.89■□□□□ 0.133e-23■■■■■ 559
UTP3Q9NQZ2 STK11IP-210ENST00000475396 2251 ntTSL 215.71■□□□□ 0.113e-23■■■■■ 559
UTP3Q9NQZ2 UBE2F-219ENST00000455999 760 ntTSL 515.63■□□□□ 0.093e-23■■■■■ 559
UTP3Q9NQZ2 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.093e-23■■■■■ 559
UTP3Q9NQZ2 UBE2F-216ENST00000445676 831 ntTSL 315.59■□□□□ 0.093e-23■■■■■ 559
UTP3Q9NQZ2 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.063e-23■■■■■ 559
UTP3Q9NQZ2 COX20-202ENST00000391839 1005 ntTSL 1 (best)15.36■□□□□ 0.053e-23■■■■■ 559
UTP3Q9NQZ2 GUCY1B2-205ENST00000532104 1912 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.043e-23■■■■■ 559
UTP3Q9NQZ2 PACS2-214ENST00000552138 765 ntTSL 215.19■□□□□ 0.023e-23■■■■■ 559
UTP3Q9NQZ2 ARMC5-201ENST00000268314 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.013e-23■■■■■ 559
UTP3Q9NQZ2 LINC00969-321ENST00000629990 806 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.053e-23■■■■■ 559
UTP3Q9NQZ2 MRNIP-210ENST00000519398 562 ntTSL 214.71□□□□□ -0.053e-23■■■■■ 559
UTP3Q9NQZ2 UBE2F-223ENST00000612130 2135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.083e-23■■■■■ 559
UTP3Q9NQZ2 UBE2F-SCLY-202ENST00000449891 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 214.54□□□□□ -0.083e-23■■■■■ 559
UTP3Q9NQZ2 MRNIP-222ENST00000523737 559 ntTSL 413.77□□□□□ -0.213e-23■■■■■ 559
UTP3Q9NQZ2 ZBTB22-209ENST00000441117 581 ntTSL 1 (best)13.43□□□□□ -0.263e-23■■■■■ 559
UTP3Q9NQZ2 STK11IP-204ENST00000456909 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.263e-23■■■■■ 559
UTP3Q9NQZ2 LINC00969-241ENST00000600527 852 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.273e-23■■■■■ 559
UTP3Q9NQZ2 ABCA2-214ENST00000467624 302 ntTSL 313.32□□□□□ -0.283e-23■■■■■ 559
UTP3Q9NQZ2 CLPB-204ENST00000445069 815 ntTSL 513.26□□□□□ -0.293e-23■■■■■ 559
UTP3Q9NQZ2 MORC1-201ENST00000232603 3764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.323e-23■■■■■ 559
UTP3Q9NQZ2 GUCY1B2-201ENST00000389600 2341 ntTSL 512.8□□□□□ -0.363e-23■■■■■ 559
UTP3Q9NQZ2 TBX15-202ENST00000369429 3504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.453e-23■■■■■ 559
UTP3Q9NQZ2 MRNIP-208ENST00000519213 579 ntTSL 412.17□□□□□ -0.463e-23■■■■■ 559
UTP3Q9NQZ2 CD3D-201ENST00000300692 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.462e-45■■■■■ 559
UTP3Q9NQZ2 AC109446.3-201ENST00000567344 641 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.472e-45■■■■■ 559
UTP3Q9NQZ2 BTN2A3P-203ENST00000465856 2483 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.553e-23■■■■■ 559
UTP3Q9NQZ2 TANGO6-201ENST00000261778 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.552e-8■■■■■ 559
UTP3Q9NQZ2 UBE2F-213ENST00000439780 571 ntTSL 511.24□□□□□ -0.613e-23■■■■■ 559
UTP3Q9NQZ2 NFKBIA-204ENST00000555371 690 ntTSL 311.17□□□□□ -0.623e-23■■■■■ 559
UTP3Q9NQZ2 STK11IP-207ENST00000466648 594 ntTSL 310.97□□□□□ -0.653e-23■■■■■ 559
UTP3Q9NQZ2 CLPB-210ENST00000539148 564 ntTSL 510.88□□□□□ -0.673e-23■■■■■ 559
UTP3Q9NQZ2 SEC22A-204ENST00000473494 1011 ntTSL 310.77□□□□□ -0.693e-23■■■■■ 559
UTP3Q9NQZ2 UBE2F-208ENST00000433241 803 ntTSL 210.74□□□□□ -0.693e-23■■■■■ 559
UTP3Q9NQZ2 UBE2F-210ENST00000434137 472 ntTSL 510.74□□□□□ -0.693e-23■■■■■ 559
UTP3Q9NQZ2 CD3D-204ENST00000529594 422 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.72e-45■■■■■ 559
UTP3Q9NQZ2 SEC22A-207ENST00000481965 673 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.713e-23■■■■■ 559
UTP3Q9NQZ2 UBE2F-SCLY-201ENST00000449191 951 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.723e-23■■■■■ 559
UTP3Q9NQZ2 BTN2A3P-204ENST00000466808 2559 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.743e-23■■■■■ 559
UTP3Q9NQZ2 KDM5A-201ENST00000399788 10763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.773e-23■■■■■ 559
UTP3Q9NQZ2 TEX2-207ENST00000583922 563 ntTSL 410.23□□□□□ -0.773e-23■■■■■ 559
UTP3Q9NQZ2 LINC00969-275ENST00000626677 378 ntTSL 510.14□□□□□ -0.793e-23■■■■■ 559
UTP3Q9NQZ2 MRNIP-214ENST00000520995 535 ntTSL 510.07□□□□□ -0.83e-23■■■■■ 559
UTP3Q9NQZ2 BTN2A3P-201ENST00000377662 1836 ntBASIC9.82□□□□□ -0.843e-23■■■■■ 559
UTP3Q9NQZ2 ERICH1-205ENST00000519909 636 ntTSL 39.77□□□□□ -0.853e-23■■■■■ 559
Retrieved 100 of 52,753 protein–RNA pairs in 3756.4 ms