Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD26

GOPC, Golgi-associated PDZ and coiled-coil motif-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOPCQ9HD26 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
GOPCQ9HD26 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
GOPCQ9HD26 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
GOPCQ9HD26 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
GOPCQ9HD26 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
GOPCQ9HD26 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
GOPCQ9HD26 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
GOPCQ9HD26 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
GOPCQ9HD26 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
GOPCQ9HD26 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
GOPCQ9HD26 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
GOPCQ9HD26 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
GOPCQ9HD26 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
GOPCQ9HD26 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
GOPCQ9HD26 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
GOPCQ9HD26 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
GOPCQ9HD26 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
GOPCQ9HD26 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
GOPCQ9HD26 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
GOPCQ9HD26 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
GOPCQ9HD26 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
GOPCQ9HD26 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
GOPCQ9HD26 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
GOPCQ9HD26 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
GOPCQ9HD26 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
GOPCQ9HD26 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
GOPCQ9HD26 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
GOPCQ9HD26 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
GOPCQ9HD26 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
GOPCQ9HD26 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
GOPCQ9HD26 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
GOPCQ9HD26 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
GOPCQ9HD26 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
GOPCQ9HD26 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
GOPCQ9HD26 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
GOPCQ9HD26 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
GOPCQ9HD26 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
GOPCQ9HD26 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
GOPCQ9HD26 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
GOPCQ9HD26 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
GOPCQ9HD26 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC29.68■■■□□ 2.34
GOPCQ9HD26 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
GOPCQ9HD26 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
GOPCQ9HD26 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
GOPCQ9HD26 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
GOPCQ9HD26 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
GOPCQ9HD26 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
GOPCQ9HD26 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
GOPCQ9HD26 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
GOPCQ9HD26 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
GOPCQ9HD26 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
GOPCQ9HD26 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
GOPCQ9HD26 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.64■■■□□ 2.34
GOPCQ9HD26 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
GOPCQ9HD26 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
GOPCQ9HD26 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
GOPCQ9HD26 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
GOPCQ9HD26 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
GOPCQ9HD26 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
GOPCQ9HD26 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
GOPCQ9HD26 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
GOPCQ9HD26 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
GOPCQ9HD26 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
GOPCQ9HD26 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
GOPCQ9HD26 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
GOPCQ9HD26 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC29.58■■■□□ 2.33
GOPCQ9HD26 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
GOPCQ9HD26 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
GOPCQ9HD26 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
GOPCQ9HD26 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
GOPCQ9HD26 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
GOPCQ9HD26 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
GOPCQ9HD26 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
GOPCQ9HD26 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
GOPCQ9HD26 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
GOPCQ9HD26 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
GOPCQ9HD26 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
GOPCQ9HD26 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
GOPCQ9HD26 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
GOPCQ9HD26 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
GOPCQ9HD26 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
GOPCQ9HD26 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
GOPCQ9HD26 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
GOPCQ9HD26 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
GOPCQ9HD26 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.32
GOPCQ9HD26 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
GOPCQ9HD26 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
GOPCQ9HD26 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
GOPCQ9HD26 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
GOPCQ9HD26 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
GOPCQ9HD26 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
GOPCQ9HD26 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
GOPCQ9HD26 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
GOPCQ9HD26 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
GOPCQ9HD26 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
GOPCQ9HD26 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
GOPCQ9HD26 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
GOPCQ9HD26 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
GOPCQ9HD26 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
GOPCQ9HD26 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms