Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCU9

BRMS1, Breast cancer metastasis-suppressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1Q9HCU9 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
BRMS1Q9HCU9 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
BRMS1Q9HCU9 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
BRMS1Q9HCU9 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
BRMS1Q9HCU9 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
BRMS1Q9HCU9 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
BRMS1Q9HCU9 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
BRMS1Q9HCU9 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
BRMS1Q9HCU9 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
BRMS1Q9HCU9 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
BRMS1Q9HCU9 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
BRMS1Q9HCU9 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
BRMS1Q9HCU9 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
BRMS1Q9HCU9 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
BRMS1Q9HCU9 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
BRMS1Q9HCU9 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
BRMS1Q9HCU9 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
BRMS1Q9HCU9 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
BRMS1Q9HCU9 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
BRMS1Q9HCU9 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
BRMS1Q9HCU9 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
BRMS1Q9HCU9 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
BRMS1Q9HCU9 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
BRMS1Q9HCU9 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
BRMS1Q9HCU9 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
BRMS1Q9HCU9 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
BRMS1Q9HCU9 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
BRMS1Q9HCU9 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
BRMS1Q9HCU9 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
BRMS1Q9HCU9 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC29.17■■■□□ 2.26
BRMS1Q9HCU9 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
BRMS1Q9HCU9 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
BRMS1Q9HCU9 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
BRMS1Q9HCU9 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
BRMS1Q9HCU9 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
BRMS1Q9HCU9 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
BRMS1Q9HCU9 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
BRMS1Q9HCU9 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
BRMS1Q9HCU9 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
BRMS1Q9HCU9 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
BRMS1Q9HCU9 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
BRMS1Q9HCU9 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
BRMS1Q9HCU9 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
BRMS1Q9HCU9 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
BRMS1Q9HCU9 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
BRMS1Q9HCU9 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
BRMS1Q9HCU9 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
BRMS1Q9HCU9 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
BRMS1Q9HCU9 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
BRMS1Q9HCU9 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
BRMS1Q9HCU9 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
BRMS1Q9HCU9 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
BRMS1Q9HCU9 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
BRMS1Q9HCU9 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
BRMS1Q9HCU9 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
BRMS1Q9HCU9 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
BRMS1Q9HCU9 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
BRMS1Q9HCU9 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
BRMS1Q9HCU9 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
BRMS1Q9HCU9 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
BRMS1Q9HCU9 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
BRMS1Q9HCU9 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
BRMS1Q9HCU9 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
BRMS1Q9HCU9 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
BRMS1Q9HCU9 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
BRMS1Q9HCU9 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
BRMS1Q9HCU9 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
BRMS1Q9HCU9 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
BRMS1Q9HCU9 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
BRMS1Q9HCU9 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
BRMS1Q9HCU9 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
BRMS1Q9HCU9 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
BRMS1Q9HCU9 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
BRMS1Q9HCU9 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
BRMS1Q9HCU9 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
BRMS1Q9HCU9 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
BRMS1Q9HCU9 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
BRMS1Q9HCU9 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
BRMS1Q9HCU9 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
BRMS1Q9HCU9 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
BRMS1Q9HCU9 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
BRMS1Q9HCU9 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
BRMS1Q9HCU9 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
BRMS1Q9HCU9 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
BRMS1Q9HCU9 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
BRMS1Q9HCU9 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
BRMS1Q9HCU9 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
BRMS1Q9HCU9 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
BRMS1Q9HCU9 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
BRMS1Q9HCU9 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
BRMS1Q9HCU9 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
BRMS1Q9HCU9 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
BRMS1Q9HCU9 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
BRMS1Q9HCU9 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
BRMS1Q9HCU9 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
BRMS1Q9HCU9 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
BRMS1Q9HCU9 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
BRMS1Q9HCU9 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
BRMS1Q9HCU9 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
BRMS1Q9HCU9 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms