Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCJ6

VAT1L, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog-like, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1LQ9HCJ6 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
VAT1LQ9HCJ6 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
VAT1LQ9HCJ6 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
VAT1LQ9HCJ6 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
VAT1LQ9HCJ6 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
VAT1LQ9HCJ6 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
VAT1LQ9HCJ6 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
VAT1LQ9HCJ6 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
VAT1LQ9HCJ6 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
VAT1LQ9HCJ6 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
VAT1LQ9HCJ6 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
VAT1LQ9HCJ6 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
VAT1LQ9HCJ6 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
VAT1LQ9HCJ6 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
VAT1LQ9HCJ6 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
VAT1LQ9HCJ6 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
VAT1LQ9HCJ6 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
VAT1LQ9HCJ6 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
VAT1LQ9HCJ6 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
VAT1LQ9HCJ6 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
VAT1LQ9HCJ6 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
VAT1LQ9HCJ6 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
VAT1LQ9HCJ6 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
VAT1LQ9HCJ6 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
VAT1LQ9HCJ6 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
VAT1LQ9HCJ6 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
VAT1LQ9HCJ6 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
VAT1LQ9HCJ6 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
VAT1LQ9HCJ6 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
VAT1LQ9HCJ6 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
VAT1LQ9HCJ6 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
VAT1LQ9HCJ6 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
VAT1LQ9HCJ6 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
VAT1LQ9HCJ6 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
VAT1LQ9HCJ6 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
VAT1LQ9HCJ6 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
VAT1LQ9HCJ6 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
VAT1LQ9HCJ6 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
VAT1LQ9HCJ6 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
VAT1LQ9HCJ6 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC29.47■■■□□ 2.31
VAT1LQ9HCJ6 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
VAT1LQ9HCJ6 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
VAT1LQ9HCJ6 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
VAT1LQ9HCJ6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
VAT1LQ9HCJ6 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
VAT1LQ9HCJ6 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
VAT1LQ9HCJ6 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
VAT1LQ9HCJ6 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
VAT1LQ9HCJ6 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
VAT1LQ9HCJ6 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
VAT1LQ9HCJ6 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
VAT1LQ9HCJ6 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
VAT1LQ9HCJ6 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
VAT1LQ9HCJ6 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
VAT1LQ9HCJ6 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
VAT1LQ9HCJ6 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
VAT1LQ9HCJ6 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
VAT1LQ9HCJ6 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
VAT1LQ9HCJ6 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
VAT1LQ9HCJ6 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
VAT1LQ9HCJ6 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
VAT1LQ9HCJ6 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
VAT1LQ9HCJ6 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
VAT1LQ9HCJ6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
VAT1LQ9HCJ6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
VAT1LQ9HCJ6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
VAT1LQ9HCJ6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
VAT1LQ9HCJ6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
VAT1LQ9HCJ6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
VAT1LQ9HCJ6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
VAT1LQ9HCJ6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
VAT1LQ9HCJ6 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
VAT1LQ9HCJ6 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
VAT1LQ9HCJ6 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
VAT1LQ9HCJ6 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
VAT1LQ9HCJ6 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
VAT1LQ9HCJ6 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
VAT1LQ9HCJ6 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
VAT1LQ9HCJ6 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
VAT1LQ9HCJ6 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
VAT1LQ9HCJ6 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
VAT1LQ9HCJ6 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
VAT1LQ9HCJ6 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
VAT1LQ9HCJ6 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
VAT1LQ9HCJ6 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
VAT1LQ9HCJ6 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
VAT1LQ9HCJ6 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
VAT1LQ9HCJ6 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
VAT1LQ9HCJ6 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
VAT1LQ9HCJ6 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
VAT1LQ9HCJ6 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
VAT1LQ9HCJ6 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
VAT1LQ9HCJ6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
VAT1LQ9HCJ6 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
VAT1LQ9HCJ6 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
VAT1LQ9HCJ6 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
VAT1LQ9HCJ6 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
VAT1LQ9HCJ6 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
VAT1LQ9HCJ6 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
VAT1LQ9HCJ6 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms