Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB40

SCPEP1, Retinoid-inducible serine carboxypeptidase, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCPEP1Q9HB40 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCPEP1Q9HB40 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCPEP1Q9HB40 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCPEP1Q9HB40 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCPEP1Q9HB40 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SCPEP1Q9HB40 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCPEP1Q9HB40 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCPEP1Q9HB40 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCPEP1Q9HB40 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCPEP1Q9HB40 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCPEP1Q9HB40 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SCPEP1Q9HB40 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SCPEP1Q9HB40 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SCPEP1Q9HB40 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCPEP1Q9HB40 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCPEP1Q9HB40 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCPEP1Q9HB40 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SCPEP1Q9HB40 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCPEP1Q9HB40 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCPEP1Q9HB40 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCPEP1Q9HB40 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCPEP1Q9HB40 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCPEP1Q9HB40 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCPEP1Q9HB40 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCPEP1Q9HB40 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCPEP1Q9HB40 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCPEP1Q9HB40 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCPEP1Q9HB40 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCPEP1Q9HB40 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCPEP1Q9HB40 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SCPEP1Q9HB40 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCPEP1Q9HB40 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCPEP1Q9HB40 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCPEP1Q9HB40 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCPEP1Q9HB40 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCPEP1Q9HB40 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCPEP1Q9HB40 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCPEP1Q9HB40 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCPEP1Q9HB40 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCPEP1Q9HB40 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCPEP1Q9HB40 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCPEP1Q9HB40 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SCPEP1Q9HB40 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCPEP1Q9HB40 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCPEP1Q9HB40 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCPEP1Q9HB40 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SCPEP1Q9HB40 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCPEP1Q9HB40 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCPEP1Q9HB40 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCPEP1Q9HB40 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCPEP1Q9HB40 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCPEP1Q9HB40 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCPEP1Q9HB40 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCPEP1Q9HB40 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCPEP1Q9HB40 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCPEP1Q9HB40 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCPEP1Q9HB40 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCPEP1Q9HB40 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCPEP1Q9HB40 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCPEP1Q9HB40 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCPEP1Q9HB40 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCPEP1Q9HB40 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCPEP1Q9HB40 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCPEP1Q9HB40 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCPEP1Q9HB40 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCPEP1Q9HB40 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCPEP1Q9HB40 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCPEP1Q9HB40 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCPEP1Q9HB40 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCPEP1Q9HB40 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCPEP1Q9HB40 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SCPEP1Q9HB40 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
SCPEP1Q9HB40 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCPEP1Q9HB40 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCPEP1Q9HB40 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCPEP1Q9HB40 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCPEP1Q9HB40 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCPEP1Q9HB40 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCPEP1Q9HB40 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCPEP1Q9HB40 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCPEP1Q9HB40 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCPEP1Q9HB40 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCPEP1Q9HB40 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCPEP1Q9HB40 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCPEP1Q9HB40 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCPEP1Q9HB40 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCPEP1Q9HB40 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCPEP1Q9HB40 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCPEP1Q9HB40 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCPEP1Q9HB40 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCPEP1Q9HB40 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCPEP1Q9HB40 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCPEP1Q9HB40 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCPEP1Q9HB40 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SCPEP1Q9HB40 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SCPEP1Q9HB40 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCPEP1Q9HB40 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCPEP1Q9HB40 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCPEP1Q9HB40 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCPEP1Q9HB40 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms