Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAS3

SLC28A3, Solute carrier family 28 member 3, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC28A3Q9HAS3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
SLC28A3Q9HAS3 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLC28A3Q9HAS3 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLC28A3Q9HAS3 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
SLC28A3Q9HAS3 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
SLC28A3Q9HAS3 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLC28A3Q9HAS3 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLC28A3Q9HAS3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLC28A3Q9HAS3 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
SLC28A3Q9HAS3 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLC28A3Q9HAS3 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLC28A3Q9HAS3 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLC28A3Q9HAS3 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLC28A3Q9HAS3 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLC28A3Q9HAS3 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLC28A3Q9HAS3 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLC28A3Q9HAS3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLC28A3Q9HAS3 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
SLC28A3Q9HAS3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.57■■■□□ 2
SLC28A3Q9HAS3 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SLC28A3Q9HAS3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SLC28A3Q9HAS3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SLC28A3Q9HAS3 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SLC28A3Q9HAS3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SLC28A3Q9HAS3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SLC28A3Q9HAS3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SLC28A3Q9HAS3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SLC28A3Q9HAS3 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SLC28A3Q9HAS3 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
SLC28A3Q9HAS3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SLC28A3Q9HAS3 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SLC28A3Q9HAS3 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SLC28A3Q9HAS3 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SLC28A3Q9HAS3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SLC28A3Q9HAS3 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SLC28A3Q9HAS3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SLC28A3Q9HAS3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SLC28A3Q9HAS3 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SLC28A3Q9HAS3 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SLC28A3Q9HAS3 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SLC28A3Q9HAS3 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
SLC28A3Q9HAS3 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
SLC28A3Q9HAS3 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SLC28A3Q9HAS3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
SLC28A3Q9HAS3 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SLC28A3Q9HAS3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SLC28A3Q9HAS3 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SLC28A3Q9HAS3 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SLC28A3Q9HAS3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC28A3Q9HAS3 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC28A3Q9HAS3 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC28A3Q9HAS3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC28A3Q9HAS3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC28A3Q9HAS3 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLC28A3Q9HAS3 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SLC28A3Q9HAS3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SLC28A3Q9HAS3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SLC28A3Q9HAS3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SLC28A3Q9HAS3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SLC28A3Q9HAS3 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SLC28A3Q9HAS3 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
SLC28A3Q9HAS3 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SLC28A3Q9HAS3 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SLC28A3Q9HAS3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLC28A3Q9HAS3 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLC28A3Q9HAS3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SLC28A3Q9HAS3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SLC28A3Q9HAS3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLC28A3Q9HAS3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLC28A3Q9HAS3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
SLC28A3Q9HAS3 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLC28A3Q9HAS3 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLC28A3Q9HAS3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SLC28A3Q9HAS3 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SLC28A3Q9HAS3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SLC28A3Q9HAS3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SLC28A3Q9HAS3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SLC28A3Q9HAS3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
SLC28A3Q9HAS3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SLC28A3Q9HAS3 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
SLC28A3Q9HAS3 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLC28A3Q9HAS3 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLC28A3Q9HAS3 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLC28A3Q9HAS3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SLC28A3Q9HAS3 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
SLC28A3Q9HAS3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SLC28A3Q9HAS3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SLC28A3Q9HAS3 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SLC28A3Q9HAS3 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SLC28A3Q9HAS3 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SLC28A3Q9HAS3 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SLC28A3Q9HAS3 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SLC28A3Q9HAS3 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SLC28A3Q9HAS3 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SLC28A3Q9HAS3 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SLC28A3Q9HAS3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SLC28A3Q9HAS3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SLC28A3Q9HAS3 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SLC28A3Q9HAS3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SLC28A3Q9HAS3 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms